| 水生生物DNA序列相似度的算法 |
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| 引用本文： | 于喆.水生生物DNA序列相似度的算法[J].水产学杂志,2016(5):22-26. |
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| 作者姓名： | 于喆 |
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| 作者单位： | 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家水产种质资源平台项目(2016DKA30470)，辽宁省水产种质基因库信息平台建设(201519) |
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| 摘 要： | 本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。
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| 关 键 词： | DNA序列相似度指标 水生生物 MonteCarlo模拟 |
Comparison Method of DNA Sequence Similarity in Aquatic Organisms |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | DNA sequence similarity index aquatic organisms MonteCarlo simulation |
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