| 黄颡鱼cGnRH基因的筛选鉴定及生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 王乐,卢建国,王平平,栾培贤,王秋实,孙效文.黄颡鱼cGnRH基因的筛选鉴定及生物信息学分析[J].水产学杂志,2016(4):1-5. |
| |
| 作者姓名： | 王乐 卢建国 王平平 栾培贤 王秋实 孙效文 |
| |
| 作者单位： | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江 哈尔滨,150070 |
| |
| 基金项目： | 黑龙江省科学基金项目(QC2016045);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(HSY201505) |
| |
| 摘 要： | 本研究在前期已获得的黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco转录组基础上,利用BLAST程序从中筛选获得黄颡鱼c Gn RH基因的候选序列,再通过氨基酸序列分析从中筛选获得c Gn RH的全长c DNA为261bp,编码86个氨基酸,其核心十肽的序列为QHWSHGWYPG,相对分子质量为9 755.5、理论PI值为9.02。序列同源比对发现:黄颡鱼与斑马鱼Danio rerio、草鱼Ctenopharyngodon idella、鲤Cyprinus carpio中c Gn RH氨基酸的相似性分别高达70.93%、68.60%和67.44%。用MEGA构建的黄颡鱼与其他27种硬骨鱼c Gn RH的Neighbour-joining进化树发现,黄颡鱼c Gn RH先与脂鲤科的墨西哥丽脂鲤Astyanax mexican共聚类,再依次与鲤科的斑马鱼、草鱼、黑头呆鱼Pimephales promelas、稀有鮈鲫Gobiocypris rarus等鱼的c Gn RH序列聚类。本研究首次筛选获得黄颡鱼的c Gn RH序列,并利用生物信息学软件进行鉴定分析,为后续的基因表达和c Gn RH调节生长生殖作用的研究提供序列资源及基础。
|
| 关 键 词： | 黄颡鱼 促性腺激素释放激素 序列分析 |
Screening,Identification and Bioinformatics of cGnRH Gene in Yellow Catfish (Pelteobagrus fulvidraco) |
| |
| WANG Le;LU Jian-guo;WANG Ping-ping;LUAN Pei-xian;WANG Qiu-shi;SUN Xiao-wen.Screening,Identification and Bioinformatics of cGnRH Gene in Yellow Catfish (Pelteobagrus fulvidraco)[J].Chinese Journal of Fisheries,2016(4):1-5. |
| |
| Authors: | WANG Le;LU Jian-guo;WANG Ping-ping;LUAN Pei-xian;WANG Qiu-shi;SUN Xiao-wen |
| |
| Institution: | WANG Le;LU Jian-guo;WANG Ping-ping;LUAN Pei-xian;WANG Qiu-shi;SUN Xiao-wen;Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences; |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Pelteobagrus fulvidraco GnRH sequence analysis |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
