2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较 |
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作者姓名: | 秦梦雪 孙新颖 万晓媛 刘庆慧 黄 倢 |
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作者单位: | 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 农业部海水养殖病害防治重点实验室 青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 农业部海水养殖病害防治重点实验室 青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 农业部海水养殖病害防治重点实验室 青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 农业部海水养殖病害防治重点实验室 青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 农业部海水养殖病害防治重点实验室 青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071 |
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摘 要: | 为了解我国白斑综合征病毒(WSSV)流行变异特征,本研究对2015年4~10月期间在山东、江苏、天津、浙江、海南和广东6省市采集到的57份WSSV阳性的样本,通过特异性的扩增目的片段,根据测序结果分析比较不同地区、不同分离株之间在ORF14/15、ORF23/24上的缺失变异情况,以及ORF75、ORF94和ORF125上的重复单元(Repeat unit, RU)数目差异。结果显示,在ORF14/15扩增中,分别有6530、5908和5725 bp的片段缺失,而在ORF23/24扩增中均有12070 bp大片段的缺失,ORF75的45 bp的RU数目分别为1、2和3,102 bp的RU数目均为1,而ORF94的RU数目分别为4、5、10和12不等,ORF125的RU数目为3、5和6。结果表明,WSSV在部分开放型阅读框上表现出明显的变异差异,而在某些开放型阅读框上的缺失情况则有显著的稳定性。
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关 键 词: | WSSV ORF 缺失 变异 |
收稿时间: | 2017/1/8 0:00:00 |
修稿时间: | 2017/2/27 0:00:00 |
Variable Sequence Comparison of WSSV Regions from Different Parts of China in 2015 |
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Authors: | QIN Mengxue SUN Xinying WAN Xiaoyuan LIU Qinghui and HUANG Jie |
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Abstract: | |
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Keywords: | WSSV ORF Deletion Variation |
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