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基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发
作者姓名:潘 婷  张 岩  张辉  高天翔  肖永双  姜云荣
作者单位:1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,中国科学院海洋研究所 青岛 266071,中国海洋大学水产学院 青岛 266003,中国科学院海洋研究所 青岛 266071,1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071
基金项目:国家科技基础条件平台项目(2006DKA30470-006)资助
摘    要:利用Roche 454 GS FLX平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选,并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析,得到247种多态性位点,其中完美型占52.22%,非完美型占20.24%,复合型占27.54%,(AC)n、(AG)n两碱基重复类型的比例是44%,重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物,采用5个野生个体,利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价,4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,不同位点得到的等位基因范围为3?8,平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明,454 GS FLX提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。

关 键 词:Roche  454  GS  FLX  钝吻黄盖鲽  开发  微卫星标记
收稿时间:2014/1/6 0:00:00
修稿时间:2014/3/17 0:00:00

Microsatellite Loci Isolated by Roche 454 GS FLX in Pleuronectes yokohamae
Abstract:
Keywords:Roche 454 GS FLX  Pleuronectes yokohamae  Isolating  Microsatellite markers
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