| 脊尾白虾3个野生群体线粒体COI基因的遗传多样性及其系统发育分析 |
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| 作者姓名： | 马朋 刘萍 李健 李吉涛 陈萍 |
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| 作者单位： | 1. 大连海洋大学,116023;农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071
2. 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室/中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目，国家自然科学基金，中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费 |
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| 摘 要： | 采用PCR扩增技术对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾的3个野生群体共计62个个体的线粒体COI基因片段进行扩增和测序,获得长度为658 bp核苷酸序列.62条序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为31.53％、22.63％、27.30％、18.53％和58.83％,A+T含量显著高于G+C含量,这一结果与甲壳类、双壳贝类等的COI线粒体基因片段中的观察结果相似.通过统计变异位点、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数进行基因序列变异分析.AMOVA分析表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.3611(P＜0.01),群体间存在较高的遗传分化,其中象山湾群体与莱州湾群体之间的遗传分化系数最高,莱州湾群体与海洲湾群体之间的遗传分化系数最低.另外用MEGA4.0软件中的NJ法构建分子进化树,同时由NCBI下载同源序列,探讨了长臂虾亚科几个种的系统进化关系,用NJ法构建的系统树显示,脊尾白虾不同单倍型先与长臂虾属和小长臂虾属聚为一支,然后与沼虾属聚为一支.
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| 关 键 词： | 脊尾白虾 野生群体 COI基因 遗传多样性 系统进化 |
| 收稿时间： | 2011/3/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2011/5/25 0:00:00 |
The genetic diversity and phylogenetic analysis of COI gene in mitochondrial DNA of three populations of Exopalaemon carinicauda |
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| Authors: | MA Peng LIU Ping LI Jian LI Ji-tao CHEN Ping |
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