| 基因条码在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)不同品系间种质鉴定中的适用性 |
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| 作者姓名： | 曹殿嘉 严兴洪 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海201306;2. 上海海洋大学水产与生命学院 上海201306;上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家高科技研究发展计划(863计划)项目(2012AA10A411)、国家自然科学基金项目(31072208)、国家海洋局公益专项(201105008；201105023)、国家农业科技成果转化资金项目(2013GB2C220537)、农业部公益性专项(200903030)、上海市科委重点科技攻关项目(10391901100)、上海高校水产学一流学科建设项目、福建省科技重大专项(2011NZ0001-1)和福建省省长专项基金(2014S1477-10)共同资助 |
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| 摘 要： | 为寻找适宜的条斑紫菜(Pyropia yezoensis)品系间种质分子标记鉴定法,利用4种基因条码(RUBISCO Spacer、UPA、Cox2-3和ITS-5.8S)对产自中国和日本的6个条斑紫菜品系的亲缘关系进行了分析研究.结果显示,在6个条斑紫菜品系中,上述4种基因条码的序列同源性较高,同源性为97.8％-100％,其中,RUBISCO Spacer序列的同源性为100％.UPA序列的同源性分析结果显示,在中国产的LS、B4、HT和TM18品系中,该序列完全相同,但与日本产的GT和ROS-2两个品系的序列有差异,该序列的同源性为99.2％.在6个品系中,Cox2-3和ITS-5.8S序列的同源性相对较低,分别为97.8％-99.2％和98.4％-99.8％.根据UPA、Cox2-3和ITS-5.8S基因条码通过邻接法构建的系统进化树显示,依据ITS-5.8S和UPA序列均能分别区分中国产的4个品系(LS、B4、HT和TM18)与日本产的两个品系(GT和ROS-2),分别形成两个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系一致.但利用ITS-5.8S序列均能对中国产的4个品系和日本产的两个品系进行再区分,而利用UPA序列却无法对中国产的4个品系进行再区分,只能区分日本产的两个品系.使用Cox2-3序列则将GT、ROS-2、LS和TM18这4个品系聚成一个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系不一致.上述结果说明,利用ITS-5.8S序列对本研究的6个条斑紫菜品系进行种质鉴定,效果最好.
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| 关 键 词： | 条斑紫菜 基因条码 品系 种质鉴定 |
| 收稿时间： | 2015/4/30 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/5/25 0:00:00 |
Applicability of DNA Barcoding in the Identification of Different Strains in Pyropia yezoensis |
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| Authors: | CAO Dianjia and YAN Xinghong |
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| Institution: | College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306; and College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306;Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources, Shanghai Ocean University, Ministry of Education, Shanghai 201306 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pyropia yezoensis DNA barcodings Strains Germplasm identification |
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