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棘头梅童鱼肝型脂肪酸结合蛋白基因克隆及组织表达分析
引用本文:欧阳文杰,宋炜,陈佳,桂福坤,程家骅,谢正丽,冯广朋.棘头梅童鱼肝型脂肪酸结合蛋白基因克隆及组织表达分析[J].水产科技情报,2022,49(6):317-324.
作者姓名:欧阳文杰  宋炜  陈佳  桂福坤  程家骅  谢正丽  冯广朋
作者单位:浙江海洋大学,国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山 316022;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业农村部远洋与极地渔业创新重点实验室,上海 200090;福建福鼎海鸥水产食品有限公司,大黄鱼育种国家重点实验室,福建宁德 352103;中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所,农业农村部渔业装备与工程技术重点实验室,上海 200092
基金项目:科技部国家重点研发计划——蓝色粮仓科技创新专项(2020YFD0900805);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资 金(东2019M02);浙江省重点研发项目(2020C02015);现代农业产业技术体系专项(CARS-47-G25);中国水产科学研究院科技创新团队项目(2020TD14)。
摘    要:为进一步了解肝型脂肪酸结合蛋白基因(L-FABP基因)在棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)营养调控、脂肪酸代谢和免疫应答等方面的功能作用,以棘头梅童鱼全基因组组装数据为基础,获得L-FABP基因的含开放阅读框的cDNA序列,利用生物信息学方法分析编码的蛋白质结构及进化关系,采用荧光定量(qRT-PCR)技术研究了不同组织中L-FABP基因的表达情况。结果表明,L-FABP基因cDNA序列为475 bp,其中5’非翻译区为51 bp,3’非翻译区为40 bp,开放阅读框为384 bp,编码127个氨基酸。其结构由10个β-折叠链和2个α-螺旋链组成,在氨基酸3~126位点间具有保守的脂质/胞质性脂肪酸结合结构域。棘头梅童鱼L-FABP基因与大黄鱼、条纹狼鲈同源性较近,与绿河鲀、尼罗罗非鱼和斑马鱼同源性较远。L-FABP基因在棘头梅童鱼肝脏、肠道、眼、大脑、心脏、肌肉、胃、鳃、脾脏、头肾和中肾中均有表达,其中肝脏中的L-FABP相对表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05)。

关 键 词:棘头梅童鱼  肝型脂肪酸结合蛋白  基因克隆  组织表达
收稿时间:2022/3/1 0:00:00

Gene cloning and tissue expression analysis of the liver fatty acid-binding protein gene in Collichthys lucidus
OUYANG Wenjie,SONG Wei,CHEN Ji,GUI Fukun,CHENG Jiahu,XIE Zhengli,FENG Guangpeng.Gene cloning and tissue expression analysis of the liver fatty acid-binding protein gene in Collichthys lucidus[J].Fisheries Science & Technology Information,2022,49(6):317-324.
Authors:OUYANG Wenjie  SONG Wei  CHEN Ji  GUI Fukun  CHENG Jiahu  XIE Zhengli  FENG Guangpeng
Institution:National Engineering Research Center for Marine Aquaculture, Zhejiang Ocean University,Zhoushan 316022,China;Key Laboratory of Oceanic and Polar Fisheries,Ministry of Agriculture and Rural Affairs, East China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Shanghai 200090,China;State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding,Fuding Seagull Fishing Food Co.,Ltd.,Ningde 352103,China;Key Laboratory of Fishery Equipment and Engineering Technology,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Fishery Machinery and Instrument Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Shanghai 200092,China
Abstract:
Keywords:Collichthys lucidus  liver fatty acid binding protein  gene cloning  tissue expression
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