| 刀鲚MSTN基因遗传多态性与生长性状的关联分析 |
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| 引用本文： | 于爱清,施永海,徐嘉波.刀鲚MSTN基因遗传多态性与生长性状的关联分析[J].水产科技情报,2021,48(2):69-76. |
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| 作者姓名： | 于爱清 施永海 徐嘉波 |
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| 作者单位： | 上海市水产研究所,上海市水产技术推广站,上海 200433 |
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| 基金项目： | 上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字( 2016) 第6-2-2号]；上海市科学技术委员会自然科学基金(19ZR1477900)。 |
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| 摘 要： | 为筛选刀鲚(Coilia ectenes)生长性状遗传改良的分子遗传标记,基于现有刀鲚转录组数据,利用基因克隆技术获得养殖刀鲚肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的全长序列,采用PCR产物直接测序和SNaPshot技术分别进行基因多态性的筛选和分型,并将不同基因型与刀鲚的生长性状(体长、体高和体质量)进行关联分析。结果显示,养殖刀鲚MSTN基因的DNA序列主要由2个内含子和3个外显子组成,经SNP位点筛选,仅在第1内含子上筛选到2个颠换突变位点(g.564G>T和g.755G>T)和1个转换突变位点(g.786C>T);将3个SNP位点与生长性状进行关联分析发现,SNP位点g.786C>T与刀鲚的体长、体高和体质量呈显著性负相关,具有TT基因型个体的体长、体高和体质量显著低于CC型和CT型(P<0.05),而SNP位点g.564G>T和g.755G>T的不同基因型仅与刀鲚的体高具有一定程度的相关性;3个SNP位点对养殖刀鲚的群体遗传分析显示,刀鲚养殖群体的观测杂合度(H O)、期望杂合度(H E)和多态信息含量(PIC)分别为0.280~0.480、0.332~0.455和0.277~0.351,3个SNP位点均属于中度多态(0.25T有望作为剔除劣质刀鲚繁育亲本的候选分子标记。
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| 关 键 词： | 刀鲚 MSTN基因 生长性状 单核苷酸多态性 关联分析 |
| 收稿时间： | 2020/12/8 0:00:00 |
Single nucleotide polymorphisms of MSTN gene and its association with growth traits in Coilia ectenes |
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| Yu Aiqing,SHI Yonghai,XU Jiabo.Single nucleotide polymorphisms of MSTN gene and its association with growth traits in Coilia ectenes[J].Fisheries Science & Technology Information,2021,48(2):69-76. |
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| Authors: | Yu Aiqing SHI Yonghai XU Jiabo |
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| Institution: | (Shanghai Fisheries Research Institute,Shanghai Fisheries Technical Extension Station,Shanghai 200433,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Coilia ectenes MSTN growth traits SNP association analysis |
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