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食蚊鱼CYP19a基因的克隆与序列分析
引用本文:甘为,方展强.食蚊鱼CYP19a基因的克隆与序列分析[J].水产学报,2016,40(10):1542-1555.
作者姓名:甘为  方展强
作者单位:华南师范大学生命科学学院,广东省高等学校生态与环境科学重点实验室,广东广州510631
基金项目:广东高校城市水环境生态治理与修复工程技术研究中心建设项目(2012gczxA004)
摘    要:硬骨鱼类CYP19基因与生物的性别分化和激素调节相关,因此可开发用来探究环境激素污染与基因表达的关系。本研究首次克隆和分析了食蚊鱼CYP19a cDNA的全系列,为将CYP19基因作为监测环境激素生物标志物的研究提供了全面的实验数据。根据CYP19a基因c DNA保守区域设计引物,扩增保守区域并测序。采用RACE法扩增食蚊鱼CYP19a基因c DNA序列全长,对其蛋白序列进行同源性分析,并将序列应用于CYP19a mRNA转录水平的RT-PCR法检测中。成功克隆食蚊鱼CYP19a基因全长,获得CYP19a基因总长为2020 bp,ORF为238~1791 bp,共编码518个氨基酸,对其编码的蛋白质进行有关信号肽、跨膜螺旋、亲水性/疏水性、一级结构、二级结构和三级结构分析,与其他硬骨鱼类底鰆、青鰆、平鲷、鲫、鲤和斑马鱼的性腺CYP19a基因作同源性比较,其基因相似度分别为93%、84%、84%、71%、71%和66%。用MEGA6.0软件对19个物种的CYP19a基因进行聚类分析,食蚊鱼CYP19a基因与底鰆、青鰆同源性最高,说明芳香化酶在进化上相对保守。确定从食蚊鱼性腺所克隆的CYP19a基因是芳香化酶基因,证明食蚊鱼的芳香化酶是由CYP19a和CYP19b两种基因编码的。食蚊鱼卵巢芳香化酶具有3个高度保守的片段,并具有催化活性。

关 键 词:食蚊鱼  CYP19a基因  cDNA末端快速扩增法  序列分析
收稿时间:2015/12/3 0:00:00
修稿时间:2016/5/28 0:00:00

Molecular cloning and analysis of CYP19a gene in mosquitofish (Gambusia affinis)
GAN Wei and FANG Zhanqiang.Molecular cloning and analysis of CYP19a gene in mosquitofish (Gambusia affinis)[J].Journal of Fisheries of China,2016,40(10):1542-1555.
Authors:GAN Wei and FANG Zhanqiang
Institution:Key Laboratory of Ecology and Environmental Science in Guangdong Higher Education, College of Life Science, South China Normal University, Guangzhou 510631, China and Key Laboratory of Ecology and Environmental Science in Guangdong Higher Education, College of Life Science, South China Normal University, Guangzhou 510631, China
Abstract:
Keywords:Gambusia affinis  CYP19a  rapid amplification of cDNA ends  sequence analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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