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基于线粒体COⅠ基因的中国近海棱鳀属鱼类DNA条形码
引用本文:宫亚运,章群,曹艳,吕金磊,杨喜书.基于线粒体COⅠ基因的中国近海棱鳀属鱼类DNA条形码[J].水产学报,2016,40(10):1513-1520.
作者姓名:宫亚运  章群  曹艳  吕金磊  杨喜书
作者单位:暨南大学水生生物研究中心,热带亚热带水生态工程教育部工程研究中心,广东广州510632
基金项目:国家自然科学基金(41071034);中央高校基本科研业务费专项(21613105);欧盟Erasmus Mundus TECHNO I博士后教育交流项目资助
摘    要:为明确中国大陆近海棱鳀属鱼类的分类地位,采用国际通用的COⅠ基因5'端652bp序列作为DNA条形码,对中国近海棱鳀属全部6种鱼类62尾标本进行鉴定分析。结果发现,所分析样品的序列碱基组成为T:29.0%,C:26.3%,A:25.3%,G:19.4%,A+T含量(54.3%)高于G+C含量(45.7%),转换/颠换率为3.76。6种棱鳀属鱼类组成5个自展支持率为100%的分支,除黄吻棱鳀和中颌棱鳀各为单系但聚合为一支外,其余4种均独立成支;分支内与分支间平均遗传距离分别为0.2%(0.0%~0.4%)和17.7%(15.7%~19.0%)。赤鼻棱鳀、汉氏棱鳀、杜氏棱鳀和长颌棱鳀均符合Hebert提出的种间遗传距离(15.7%~18.6%)大于或等于10倍种内遗传距离(0.0%~0.3%)的标准,确定了它们的物种有效性。黄吻棱鳀和中颌棱鳀的种内遗传距离皆为0.1%,与其他4种棱鳀的种内遗传距离处于同一水平;但二者种间遗传距离仅为0.6%,明显低于其他物种间的种间遗传距离,属于一般物种的种内遗传距离范围,表明二者亲缘关系很近;由于外部形态存在一定的差异,且在分子系统树上各为单系,二者可作为同一物种的2个不同亚种处理,但也不排除是2个近期分化形成物种的可能,在资源管理上应作为2个不同的进化显著单位分别加以管理。

关 键 词:棱鳀属  DNA条形码  COⅠ基因  中国大陆近海
收稿时间:2015/10/10 0:00:00
修稿时间:2016/4/19 0:00:00

DNA barcoding of Thryssa in coastal waters of China based on the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I sequence
GONG Yayun,ZHANG Qun,CAO Yan,L&#; Jinlei and YANG Xishu.DNA barcoding of Thryssa in coastal waters of China based on the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I sequence[J].Journal of Fisheries of China,2016,40(10):1513-1520.
Authors:GONG Yayun  ZHANG Qun  CAO Yan  L&#; Jinlei and YANG Xishu
Institution:Engineering Research Center of Tropical and Subtropical Aquatic Ecological Engineering, Ministry of Education, Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China,Engineering Research Center of Tropical and Subtropical Aquatic Ecological Engineering, Ministry of Education, Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China,Engineering Research Center of Tropical and Subtropical Aquatic Ecological Engineering, Ministry of Education, Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China,Engineering Research Center of Tropical and Subtropical Aquatic Ecological Engineering, Ministry of Education, Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China and Engineering Research Center of Tropical and Subtropical Aquatic Ecological Engineering, Ministry of Education, Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China
Abstract:
Keywords:Thryssa  DNA barcoding  cytochrome oxidase subunit 1  coastal waters of China mainland
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