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| 缢蛏β-ACTIN-1基因的分子特性及其表达分析 | |
| 引用本文： | 冯冰冰,钟玉民,牛东红,陈慧,林国文,李家乐.缢蛏β-ACTIN-1基因的分子特性及其表达分析[J].水产学报,2011,35(5):650-659. |
| 作者姓名： | 冯冰冰 钟玉民 牛东红 陈慧 林国文 李家乐 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海201306 2. 福建省闽东水产研究所,福建宁德,352100 3. 上海海洋大学水产与生命学院,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海201306;上海海洋大学水产与生命学院,上海市高校水产养殖学E-研究院,上海201306 |
| 基金项目： | 国家“八六三”高技术研究发展计划(2006AA10A410);福建省海洋与渔业局重点项目(闽海鱼 2007015);上海高校创新团队建设项目 |
| 摘 要： | 为研究缢蛏功能基因的表达调控,利用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了缢蛏肝脏组织的标准化cDNA文库。对随机选取的5 679个克隆进行随机测序,比对、筛选出2条β-actin同源序列,对其中一条EST序列两端进行扩增、测序,然后进行5′RACE(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增、测序,拼接得到全长cDNA序列,命名为β-ACTIN 1。该序列全长为1 552 bp,包括73 bp的5′非翻译区和348 bp的3′非翻译区,以及1 131 bp的开放阅读框。阅读框共编码376个氨基酸,推算分子量约为41.95 ku,理论等电点为5.23。与其他7种软体动物的氨基酸序列进行比对发现,β-ACTIN 1基因的氨基酸序列中Ile179、Glu229、Ser232、Pro236、Ile248、Asn272、Cys273、Val283、Ser320、Ser325、Val330、Pro339等12个氨基酸残基具有特异性;同时发现缢蛏β-ACTIN 1氨基酸序列与其他软体动物的相似性高达97%以上。系统进化分析显示,缢蛏首先与软体动物聚在一起,然后与节肢动物聚在一起,再依次与鱼类、两栖类、哺乳类聚在一起。荧光定量PCR检测结果显示,β-ACTIN 1基因在缢蛏各组织中的表达及鳗弧菌诱导后的表达均不稳定,不适合作为内参基因。 |
| 关 键 词： | 缢蛏 cDNA文库 β-ACTIN 1基因 序列分析 基因表达 |
| 收稿时间： | 2010/12/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 3/19/2011 6:38:15 PM |
Molecular characteristics and expression analysis of β-ACTIN 1 gene from Sinonovacula constricta |
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| FENG Bing-bing,ZHONG Yu-min,NIU Dong-hong,CHEN Hui,LIN Guo-wen and LI Jia-le.Molecular characteristics and expression analysis of β-ACTIN 1 gene from Sinonovacula constricta[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(5):650-659. | |
| Authors: | FENG Bing-bing ZHONG Yu-min NIU Dong-hong CHEN Hui LIN Guo-wen and LI Jia-le |
| Institution: | Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University,Ministry of Education,Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University,Ministry of Education,Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University,Ministry of Education,Mindong Fisheries Research Institute,Mindong Fisheries Research Institute,Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University,Ministry of Education |
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