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| 日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析 | |
| 引用本文： | 冯建彬,马克异,李家乐,华雪铭,丁怀宇.日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析[J].水产学报,2010,34(5):688-695. |
| 作者姓名： | 冯建彬 马克异 李家乐 华雪铭 丁怀宇 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306;淮阴师范学院江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223300 2. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306 3. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306;上海市高校水产养殖学E研究院,上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306 4. 淮阴师范学院江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223300 |
| 基金项目： | 江苏省苏北科技发展计划项目(BN2009036); 江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室开放课题(HZHL0803); 上海海洋大学博士科研启动基金(B-8201-08-0279); 上海市科委重点科技攻关计划项目(073205111); 上海市重点学科建设项目(Y1101) |
| 摘 要： | 采用(CT)15、(CA)15两种生物素标记及磁珠富集法构建了太湖日本沼虾基因组微卫星富集文库。120个微卫星克隆中83个位点的核心序列重复在10个以上,长度介于191～580bp,平均为311bp;重复类型中,(CA/GT)n及(AG/TC)n分别占59.09%及20.45%,还检测到(GC)n、(AAG)n、(ACAA)n和(GGCAGA)n等17种类型,包括25.75%完美型、20.45%非完美型和53.80%复合性。用其中12条微卫星引物扩增吴江、滨湖、宜兴和吴兴4个群体240个个体的基因组DNA,各位点表现出较高的遗传多样性,除Mni86、Mni103和Mni114外,其它群体位点大都表现出显著的杂合子缺失,4个群体的遗传分化为低度分化(FST<0.05),4个群体中97.58%遗传变异存在于群体内,仅有2.42%的遗传变异来自于群体之间;吴江和吴兴群体亲缘关系最近,与宜兴和滨湖群体亲缘关系渐远。 |
| 关 键 词： | 日本沼虾 微卫星引物 筛选 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2009/11/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/1/14 0:00:00 |
Isolation and genetic diversity analysis of microsatellite DNA in Macrobrachium nipponense |
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| FENG Jian-bin,MA Ke-yi,Li Jiale,HUA Xue-ming and DING Huai-yu.Isolation and genetic diversity analysis of microsatellite DNA in Macrobrachium nipponense[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(5):688-695. | |
| Authors: | FENG Jian-bin MA Ke-yi Li Jiale HUA Xue-ming and DING Huai-yu |
| Institution: | FENG Jian-bin1,2,MA Ke-yi1,LI Jia-le1,3*,HUA Xue-ming1,DING Huai-yu2 (1. Key Laboratory of Exploration , Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai OceanUniversity,Ministry of Education,Shanghai 201306,China,2. Jiangsu Key Laboratory for Eco-Agricultural Biotechnology Around Lake Hongze,Huaiyin Nomal College,Huaian 223300,3. Aquaculture Division,E-Institute of Shanghai Universities,College of Fisheries , Life Science,Shanghai Ocean University,China) |
| Abstract: | Microsatellite-enhanced genomic library of oriental river prawn Macrobrachium nipponense of Lake Taihu was constructed using repeat-enrichment method with biotin-labeled oligos (CA)15 and (CT)15]and streptavidin magnetic beads. From a total of randomly selected 120 clones,83 clones with more than ten motif repeats were positive. And the sequence size ranges from 191 to 580 bp with an average of 311 bp. The (CA/ GT)n and (AG/TC)n were the abundant microsatellite motifs with a percentage of 59. 09% and 20. 4... |
| Keywords: | Macrobrachium nipponense microsatellite isolation population genetic diversity |
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