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| 马氏珠母贝EST微卫星的筛选 | |
| 引用本文： | 石耀华,洪葵,郭希明,王爱民.马氏珠母贝EST微卫星的筛选[J].水产学报,2008,32(2):174-181. |
| 作者姓名： | 石耀华 洪葵 郭希明 王爱民 |
| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,热带作物生物技术国家重点实验室,华南热带农业大学,海南,海口,571101;海南省热带水生生物技术重点实验室,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南,海口,570228;Haskin Shellfish Research Laboratory,Institute of Marine and Coastal Sciences, Rutgers University,6959 Miller Avenue,Port Norris,NJ 08349,USA 2. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,热带作物生物技术国家重点实验室,华南热带农业大学,海南,海口,571101 3. Haskin Shellfish Research Laboratory,Institute of Marine and Coastal Sciences, Rutgers University,6959 Miller Avenue,Port Norris,NJ 08349,USA 4. 海南省热带水生生物技术重点实验室,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南,海口,570228 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) , 国家自然科学基金 , 国际科技合作项目 , 中国博士后科学基金 , 海南省自然科学基金 |
| 摘 要： | 构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%.珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%.双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%.一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对.多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具. |
| 关 键 词： | 马氏珠母贝 EST-SSR 分子遗传学 马氏珠母贝 微卫星引物 筛选 Pinctada martensii Dunker sequences screening markers 可靠的工具 资源保护 种质鉴定 遗传学研究 分子 多态性引物 合成 设计 类型 碱基 比例 重复序列 查找 |
| 文章编号： | 1000-0615(2008)02-0174-08 |
| 收稿时间： | 2008/2/25 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2007年5月27日 |
Microsatellite markers screening from EST sequences of Pinctada martensii Dunker |
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| SHI Yaohu,HONG Kui,GUO Ximing and WANG Aiming.Microsatellite markers screening from EST sequences of Pinctada martensii Dunker[J].Journal of Fisheries of China,2008,32(2):174-181. | |
| Authors: | SHI Yaohu HONG Kui GUO Ximing and WANG Aiming |
| Institution: | South China University of Tropical Agriculture, Institute of Tropical Biotechnology, CATAS,National Key Laboratory of Tropical Crop Biotechnology |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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