| 5种海水养殖石首鱼类肠道菌群多样性的比较 |
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| 引用本文： | 林能锋,龚晖,许斌福,潘滢,曾红.5种海水养殖石首鱼类肠道菌群多样性的比较[J].水产学报,2022,46(9):1701-1712. |
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| 作者姓名： | 林能锋 龚晖 许斌福 潘滢 曾红 |
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| 作者单位： | 大黄鱼育种国家重点实验室；福建省农业科学院生物技术研究所,大黄鱼育种国家重点实验室；福建省农业科学院生物技术研究所,福建省农业科学院生物技术研究所,大黄鱼育种国家重点实验室,福建省农业科学院生物技术研究所,福建师范大学生命科学学院南方海洋研究院;福建师范大学生命科学学院南方海洋研究院 |
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| 基金项目： | 大黄鱼育种国家重点实验室开放基金(项目编号：LYC2017RS03)；福建师范大学生命科学学院2019年度“溪源江学者”扶持计划 |
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| 摘 要： | 为探究海水养殖石首鱼类肠道菌群的结构特征及种间差异,本研究采用基于Illumina Hiseq2500测序平台的高通量测序技术,对福建宁德三都澳养殖的5种石首鱼类(大黄鱼(Larimichthys crocea)、黄姑鱼(Nibea albiflora)、鮸状黄姑鱼(Nibea miichthyoides)、鮸鱼(Miichthys miiuy)、眼斑拟石首鱼(Sciaenops ocellatus))的肠道菌群进行了16S rDNA V3-V4区测序。各样本得到unique tags的数目在20351到43347之间,上述5种鱼类分别得到479、626、603、518和556个OTUs(operational taxonomic units),分类注释结果显示,这些OUT隶属33个门273个属。5种石首鱼类肠道内容物和肠道壁的样品均以变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)细菌为主要优势菌群,约占总菌量的70%,在大黄鱼肠道菌群中,螺旋菌门细菌占比达26.19%,也是其主要优势菌群；在属水平上,Bacillus、Photobacterium、Vibrio、Chryseobacterium、Sphingomonas、Pseudomonas等属细菌是5种养殖石首鱼类的主要类别。对养殖石首鱼类的肠道菌群多样性的分析表明,Shannon’s 群落多样性指数：黄姑鱼>鮸状黄姑鱼>眼斑拟石首鱼>鮸鱼>大黄鱼；各种鱼类的肠道内容物菌群的多样性均高于肠道壁；对不同鱼类间的肠道菌群差异性分析显示,大黄鱼与眼斑拟石首鱼之间肠道菌群的相似度要高于黄姑鱼、鮸状黄姑鱼和鮸鱼,而黄姑鱼、鮸状黄姑鱼和鮸鱼之间的相似度较高。综上所述,5种海水养殖石首鱼类肠道菌群中存在有自身特色的核心菌群,肠道菌群结构的差异与种类间的系统进化关系相似,证明肠道菌群结构与宿主遗传因素密切相关。
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| 关 键 词： | 石首鱼 肠道 菌群结构 16S rDNA |
| 收稿时间： | 2020/12/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/7/22 0:00:00 |
Bacteriological analysis of the digestive tract of five species of mariculture Sciaenidae |
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| LIN Nengfeng,GONG Hui,XU Binfu,PAN Ying,ZENG Hong.Bacteriological analysis of the digestive tract of five species of mariculture Sciaenidae[J].Journal of Fisheries of China,2022,46(9):1701-1712. |
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| Authors: | LIN Nengfeng GONG Hui XU Binfu PAN Ying ZENG Hong |
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| Institution: | State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde Fufa Fisheries Co., Ltd., Ningde 352100, China;Institute of Biotechnology, Fujian Academy of Agriculture Sciences, Fuzhou 350003, China; State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde Fufa Fisheries Co., Ltd., Ningde 352100, China;Southern Institute of Oceanography, College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou 350117, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rearing croakers intestine microflora structure 16SrDNA |
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