| 三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 袁一鸣,李西雷,白志毅,汪桂玲,李家乐.三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析[J].水产学报,2011,35(4):481-492. |
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| 作者姓名： | 袁一鸣 李西雷 白志毅 汪桂玲 李家乐 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306
2. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306;上海海洋大学水产与生命学院,上海市高校水产养殖学E-研究院,上海201306 |
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| 基金项目： | 国家“九七三”计划前期研究专项项目(2009CB126001);国家自然科学基金项目(30871923);国家科技支撑计划项目(2006BAD01A13);上海市科委地方院校能力建设项目(08390510100) |
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| 摘 要： | 采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804 bp,包含112 bp的5′非翻译区(untranslated region,UTR),1 303 bp的3′UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)。ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35。多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG。三角帆蚌CAT基因有12个与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合的氨基酸残基,分别是Asp107、His153、Phe157、Ser160、Arg162、Asn172、Try174、Lys196、Val261、Trp262、His264和Try317,其中第261位和第264位的氨基酸在不同物种间有所区别。比对结果得到的三角帆蚌CAT基因的氨基酸序列,与软体动物的CAT基因相似性高达99%,与虾类、鱼类、两栖类、哺乳类的CAT基因相似性也达到98%~99%,可推断属于CAT3。利用CAT基因推断得到的氨基酸序列构建NJ系统树,分析显示三角帆蚌首先与软体动物聚在一起,再与虾类聚在一起,然后依次与鱼类、两栖类和哺乳类聚在一起。荧光定量结果显示,CAT基因在三角帆蚌的7个组织均有表达,其中在肾中的表达量极低,在血液中表达呈上调趋势且明显区别于其他组织,在另外5个组织中总体上呈现不统一的先上调后下调的趋势。
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| 关 键 词： | 三角帆蚌 过氧化氢酶(CAT) 基因表达 RACE-PCR |
| 收稿时间： | 10/8/2010 2:06:04 PM |
| 修稿时间： | 2011/1/11 0:00:00 |
Cloning and expression analysis of CAT gene from Hypriopsis cumingii |
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| YUAN Yi-ming,LI Xi-lei,BAI Zhi-yi,WANG Gui-ling and LI Jia-le.Cloning and expression analysis of CAT gene from Hypriopsis cumingii[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(4):481-492. |
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| Authors: | YUAN Yi-ming LI Xi-lei BAI Zhi-yi WANG Gui-ling and LI Jia-le |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hyriopsis cumingii catalase(CAT) gene expression RACE-PCR |
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