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循环水养殖系统生物滤池细菌群落的PCR-DGGE分析
引用本文:李秋芬,傅雪军,张艳,马绍赛.循环水养殖系统生物滤池细菌群落的PCR-DGGE分析[J].水产学报,2011,35(4):579-586.
作者姓名:李秋芬  傅雪军  张艳  马绍赛
作者单位:1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛,266071
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
基金项目:国家科技支撑计划项目(2006BAD09A03);国家“八六三”高技术研究发展计划(2006AA100305);农业科技成果转化资金项目(2007GB23260387);黄海所基本科研业务费项目(2007-qn-06)
摘    要:通过模拟实验对循环水养殖系统中不同初始NH 4N浓度的生物滤池中生物膜上和水中的细菌数量及群落种类组成进行了研究。对成熟生物膜及水体样品中的异养菌、氨氧化菌、亚硝酸盐氧化菌的培养计数结果表明,随着生物滤池初始氨氮浓度增大,除异养细菌数量逐渐下降外,生物膜上的氨氧化菌和亚硝酸盐氧化菌数量呈逐渐增加趋势,且均高出水样3~4个数量级;同时对上述样品的16S rRNA基因片段的PCR扩增产物进行变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析及其序列同源性分析的结果表明,生物膜和水中都有较高的细菌多样性,同一初始氨氮浓度的滤池中生物膜上的细菌多样性高于水中的。生物滤池中的细菌主要由拟杆菌门的黄杆菌纲和变形菌门的α-、β-、γ-变形菌纲的15种细菌组成。生物膜上的优势菌包括奥雷氏菌属、湖饲养者菌属、泥滩杆菌属、沉积杆菌属、雷辛格氏菌属、冷蛇形菌属和亚硝化单胞菌属等;水体中的优势菌则有明显差异,主要有蛋黄色杆菌属、Nautella,玫瑰杆菌属和一种硫氧化菌等。初始氨氮越高的滤池中,亚硝化单胞菌属的细菌在生物膜上所占比例越高,逐渐成为优势菌之一。实验证实,挂膜初期,提高水体中初始氨氮浓度,有利于硝化细菌的富集和固着,提高生物滤池的除氮效率。

关 键 词:循环水海水养殖系统    变性梯度凝胶电泳    细菌群落    硝化细菌    生物滤池    生物膜
收稿时间:2010/11/28 0:00:00
修稿时间:2011/2/11 0:00:00

PCR-DGGE analysis of bacterial communities in bio-filtors of re-circulating mariculture system
LI Qiu-fen,FU Xue-jun,ZHANG Yan and MA Shao-sai.PCR-DGGE analysis of bacterial communities in bio-filtors of re-circulating mariculture system[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(4):579-586.
Authors:LI Qiu-fen  FU Xue-jun  ZHANG Yan and MA Shao-sai
Institution:Yellow sea fisheries research insitute,CAFS,College of Fisheries and life Science, Shanghai Ocean University,Yellow sea fisheries research insitute,CAFS,Yellow sea fisheries research insitute,CAFS
Abstract:The numbers and composition of bacterial communities in bio-filters of re-circulating mariculture system were studied.The numbers of total heterotrophic bacteria,ammonium-oxidizing bacteria and nitrate-oxidizing bacteria on the matured bio-film samples from the 4 bio-filters with different initial ammonia-nitrogen concentrations(1#,2#,3#,4#)and from the water sample(5#)of 3# bio-filter were counted.The results showed that,the numbers of ammonia-oxidizing bacteria and nitrate-oxidizing bacteria on the bio-fi...
Keywords:recirculating mariculture system  denaturing gradient electrophoresis(DGGE)  bacterial communities  nitrifying bacteria  bio-filter  bio-film
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