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条石鲷线粒体COⅠ和Cytb序列的遗传变异分析
引用本文:孙鹏,尹飞,彭士明,施兆鸿.条石鲷线粒体COⅠ和Cytb序列的遗传变异分析[J].水产学报,2011,35(3):327-333.
作者姓名:孙鹏  尹飞  彭士明  施兆鸿
作者单位:中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海,200090
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(东2009M05号,东2008M14号,东2009M08号)
摘    要:通过PCR扩增与测序分别获得了长度为642 bp和1 138 bp的条石鲷线粒体COⅠ和Cytb基因片段。分析表明,COⅠ序列共定义了11个单倍型,存在21个多态性位点,发生转换4次,颠换5次。A、T、G、C碱基的平均含量分别为24.5%、30.6%、18.8%和26.1%。Cytb序列共定义了11个单倍型,存在26个多态性位点,发生转换4次,颠换3次。A、T、G、C碱基的平均含量分别为24.9%、28.3%、14.8%和32.0%。基于COⅠ和Cytb两基因序列的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均碱基差异(K)分别为 0.795、0.008 83、5.667和 0.770、0.003 54、4.025。结果表明,条石鲷群体的COⅠ和Cytb基因片段显示出较高的遗传多样性水平。本研究结果可为条石鲷资源保护及系统进化研究提供基础资料。

关 键 词:条石鲷    细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ    细胞色素b    遗传多样性
收稿时间:10/9/2010 1:09:22 PM
修稿时间:2010/12/13 0:00:00

Genetic variation of CO Ⅰ and Cytb sequences in Oplegnathus fasciatus
SUN Peng,YIN Fei,PENG Shi-ming and SHI Zhao-hong.Genetic variation of CO Ⅰ and Cytb sequences in Oplegnathus fasciatus[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(3):327-333.
Authors:SUN Peng  YIN Fei  PENG Shi-ming and SHI Zhao-hong
Institution:SUN Peng,YIN Fei,PENG Shi-ming,SHI Zhao-hong(Key and Open Laboratory of Marine and Estuarine Fisheries Resources and Ecology,Ministry of Agriculture,East China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Shanghai 200090,China)
Abstract:
Keywords:
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