福瑞鲤2号不同生长速率个体肌肉组织转录组分析 |
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引用本文: | 王兰梅,朱文彬,傅建军,董在杰.福瑞鲤2号不同生长速率个体肌肉组织转录组分析[J].水产学报,2021,45(1):79-87. |
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作者姓名: | 王兰梅 朱文彬 傅建军 董在杰 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心 |
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基金项目: | 江苏省博士后科研资助项目(2018K208C), 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020TD37)和现代农业(大宗淡水鱼)产业技术体系建设专项资金(CARS-45)。 |
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摘 要: | 鱼类通过选育获得优良生长性状的遗传分子机制目前尚不清楚。实验分析比较了2种不同生长速率福瑞鲤2号肌肉组织的转录组文库。组装后共获得392 238条测序序列(contigs)。其中可比对上斑马鱼、弓斑东方鲀、青鳉、三刺鱼、尼罗罗非鱼和松浦镜鲤的蛋白序列的比例为56.01%~77.71%。2种不同生长速率福瑞鲤2号肌肉转录组比较,获得749个差异表达基因,包括348个上调基因和401个下调基因。鉴定出了与肌肉生长相关关键基因,如mb、myl2b、tnni1、fhl1、lamb3和pdk2等。研究结果为后续基因功能的研究以及鱼类新品种优良生长性状的分子机制解析奠定了基础。
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关 键 词: | 鲤 转录组 肌肉生长 差异表达基因 |
收稿时间: | 2020/4/9 0:00:00 |
修稿时间: | 2020/5/29 0:00:00 |
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