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坛紫菜6-磷酸海藻糖合成酶(TPS)家族基因的克隆及表达特征分析
引用本文:史健志,徐燕,纪德华,陈昌生,谢潮添.坛紫菜6-磷酸海藻糖合成酶(TPS)家族基因的克隆及表达特征分析[J].水产学报,2015,39(4):485-495.
作者姓名:史健志  徐燕  纪德华  陈昌生  谢潮添
作者单位:集美大学水产学院,福建厦门,361021
基金项目:国家"八六三"高技术研究发展计划(2012AA10A411);国家自然科学基金(41176151,41276177);福建省种业创新与产业化工程(2014S1477-10)
摘    要:6-磷酸海藻糖合成酶(TPS)是植物海藻糖合成的关键酶,在植物逆境胁迫应答中发挥着重要的作用.实验以坛紫菜转录组测序获得的unigene序列为基础,采用RACE技术克隆获得坛紫菜的3条TPS基因序列:PhTPS1,PhTPS2-1和PhTPS2-2.序列分析结果表明,PhTPS1(收录号:KM580358)序列全长3 557 bp,包含一个3 462 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含1 153个氨基酸,分子量为124.2 ku,等电点为6.73,属于TPS Ⅰ亚家族;PhTPS2-1(收录号:KM519457)序列全长4 264 bp,包含一个4 044 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含1 374个氨基酸,分子量为145.2 ku,等电点为5.96;PhTPS2-2(收录号:KM519458)序列全长3 733 bp,包含一个3 324 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含1 107个氨基酸,分子量为120.2 ku,等电点为5.42.PhTPS2-1和PhTPS2-2属于TPSⅡ亚家族.基因表达水平的定量分析结果表明高温胁迫条件下,3条PhTPS基因的表达模式基本一致,均表现为先上调后下调,再上调的趋势;而PhTPS1和PhTPS2-1基因在中低水平的失水条件下,基因表达水平均没有发生显著变化,只在高水平失水胁迫下显著上调,PhTPS2-2基因在中高水平失水条件下,表达水平显著上调.说明PhTPS基因可能只在高度失水胁迫下发挥应激调节作用.

关 键 词:坛紫菜  6-磷酸海藻糖合成酶  RACE  荧光定量PCR
收稿时间:2014/9/18 0:00:00
修稿时间:2015/1/19 0:00:00

Cloning and expression analysis of trehalose-6-phosphate synthase(TPS) family genes from Pyropia haitanensis
SHI Jianzhi,XU Yan,JI Dehu,CHEN Changsheng and XIE Chaotian.Cloning and expression analysis of trehalose-6-phosphate synthase(TPS) family genes from Pyropia haitanensis[J].Journal of Fisheries of China,2015,39(4):485-495.
Authors:SHI Jianzhi  XU Yan  JI Dehu  CHEN Changsheng and XIE Chaotian
Institution:College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021, China,College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021, China,College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021, China,College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021, China and College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021, China
Abstract:
Keywords:Pyropia haitanensis  trehalose-6-phosphate synthase  RACE  real-time quantitative PCR
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