| 黄喉拟水龟性别调控相关lncRNA和mRNA的筛选及初步分析 |
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| 引用本文： | 朱彦雨,刘晓莉,王亚坤,李伟,洪孝友,朱新平,徐红艳.黄喉拟水龟性别调控相关lncRNA和mRNA的筛选及初步分析[J].水产学报,2020,44(12):1960-1975. |
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| 作者姓名： | 朱彦雨 刘晓莉 王亚坤 李伟 洪孝友 朱新平 徐红艳 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东广州 510380;上海海洋大学,水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东广州 510380 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2018YFD0900201，2018YFD0900203)；国家自然科学基金(31873035)；广州市科技计划项目(201904010172)；社会公益研究(2019HY-XKQ02)；社会公益研究(2018SJ-YZ02)；中国—东盟海上合作基金资助(CAMC-2018F)；“一带一路”沿线国家热带农业科技创新合作(2130114) |
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| 摘 要： | 性别异形在动物界广泛存在，长期以来一直是生物学中的热门话题。黄喉拟水龟性别分化属温度依赖型，其温度响应分子机制仍不清楚。为了进一步解析龟鳖动物性别分化的分子机制，本研究初步比较分析了黄喉拟水龟转录本中性别差异表达(different expressed, DE)的长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)及其调控的靶基因。首先，运用Illumina深度测序平台，通过转录组测序(RNA-Seqs)对黄喉拟水龟的精巢和卵巢进行了比较转录组学分析并筛选鉴定出雌雄差异转录本，共筛选获得8 237个DE mRNA和9 573个DE lncRNA。通过GO功能注释及 KEGG通路富集分析发现，上述差异转录本主要参与龟鳖动物性别分化和性腺发育等相关信号通路。此外，通过顺式和反式作用分析，筛选获得了一系列与生殖发育相关的(性腺发育和性别分化)受DE lncRNAs调控的靶基因。本研究为进一步阐明黄喉拟水龟温度依赖型性别的分子机制提供了线索，特别是为进一步挖掘利用龟鳖动物性别决定因子，进行龟鳖动物性控育种技术研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 黄喉拟水龟 转录组 长链非编码RNA 性别决定 性别分化 |
| 收稿时间： | 2020/3/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/5/9 0:00:00 |
Identification and analysis of lncRNAs and mRNAs involved in sex regulation in Asian yellow pond turtle (Mauremys mutica) |
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| ZHU Yanyu,LIU Xiaoli,WANG Yakun,LI Wei,HONG Xiaoyou,ZHU Xinping,XU Hongyan.Identification and analysis of lncRNAs and mRNAs involved in sex regulation in Asian yellow pond turtle (Mauremys mutica)[J].Journal of Fisheries of China,2020,44(12):1960-1975. |
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| Authors: | ZHU Yanyu LIU Xiaoli WANG Yakun LI Wei HONG Xiaoyou ZHU Xinping XU Hongyan |
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| Institution: | Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation of Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510380, China;National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
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| Abstract: | |
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