| Ccr-lncRNA172145靶向miR-206在锦鲤体色调控中的作用初探 |
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| 引用本文： | 罗明坤,王兰梅,朱文彬,傅建军,董在杰.Ccr-lncRNA172145靶向miR-206在锦鲤体色调控中的作用初探[J].水产学报,2021,45(12):1955-1964. |
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| 作者姓名： | 罗明坤 王兰梅 朱文彬 傅建军 董在杰 |
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| 作者单位： | 南京农业大学无锡渔业学院,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,南京农业大学无锡渔业学院 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2019ZY22)；农业农村部现代农业人才支撑计划项目(2016142)；江苏省研究生科研与实践创新计划(KYCX18_0738) |
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| 摘 要： | 基于前期对锦鲤皮肤组织的转录组测序数据，筛选到4条在3种皮肤（黑色、红色、白色）中显著差异表达的lncRNA；通过RNAhybrid和TargetScan靶基因软件，发现lncRNA172145与黑色素合成通路中miR-206之间存在靶向结合位点。基于CPC、CPAT及CNIT软件，对lncRNA172145进行编码能力分析，证实该序列为lncRNA，不具备编码蛋白能力。然后，利用qRT-PCR技术对该序列时空表达水平进行了检测，发现在眼睛、黑色皮肤、鳍条及血液中的表达量显著高于其他组织；自原肠胚时期表达量开始显著性上升，高水平趋势一直持续到孵化后20 d。借助双荧光素酶报告实验，进一步证实lncRNA172145与miR-206之间存在靶向调控关系。最后，通过合成miR-206拮抗剂，对miR-206进行了体内沉默，发现与注射阴性对照拮抗剂组和PBS组相比，miR-206拮抗剂组的lncRNA172145表达水平显著性升高。研究结果说明lncRNA172145可能通过靶向到miR-206，参与到黑色素合成通路的调控，这为后续深入挖掘二者在黑色素合成通路中具体的分子作用机制提供了基础资料。
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| 关 键 词： | 锦鲤 ccr-lncRNA172145 miR-206 体色 |
| 收稿时间： | 2020/11/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/1/2 0:00:00 |
Preliminary study on the role of Ccr-lncRNA172145 in targeting miR-206 in the regulation of skin color of Cyprinus carpio var. koi |
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| LUO Mingkun,WANG Lanmei,ZHU Wenbin,FU Jianjun,DONG Zaijie.Preliminary study on the role of Ccr-lncRNA172145 in targeting miR-206 in the regulation of skin color of Cyprinus carpio var. koi[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(12):1955-1964. |
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| Authors: | LUO Mingkun WANG Lanmei ZHU Wenbin FU Jianjun DONG Zaijie |
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| Institution: | Wuxi Fisheries College,Nanjing Agricultural University,Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Resources Utilization,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Resources Utilization,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Resources Utilization,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Wuxi Fisheries College,Nanjing Agricultural University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cyprinus carpio var koi Ccr-lncRNA172145 miR-206 skin color |
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