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小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用
引用本文:孙雪,吴晓微,李兴文,裴鲁青.小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用[J].水产学报,2009,33(4):565-571.
作者姓名:孙雪  吴晓微  李兴文  裴鲁青
作者单位:宁波大学教育部应用海洋生物工程重点实验室,浙江,宁波,315211
基金项目:国家自然科学基金,浙江省教育厅资助项目,宁波市自然科学基金 
摘    要:用核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)和叶绿体rbcL基因对小球藻属((Jhlorella)6株小球藻的种间和种内关系进行了分析.克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列(ITS和rbcL序列各为15条)一起进行比较分析.结果显示:ITS序列长度在小球藻种内高度保守,在种间变异较大;而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守.15株小球藻ITS序列间遗传距离在0.000~0.663.之间;而15株小球藻rbcL序列间距离在0.000~0.216之间.6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系;蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近;椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远.研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定.

关 键 词:小球藻  内转录间隔区  rbcL基因  遗传距离  种间关系  种内关系
收稿时间:2007/10/31 0:00:00
修稿时间:4/1/2008 12:00:00 AM

Molecular identification of Chlorella strains based on sequence analysis of nuclear rDNA ITS and chloroplast rbcL gene
SUN Xue,WU Xiaowei,Li Xingwen and PEI Luqing.Molecular identification of Chlorella strains based on sequence analysis of nuclear rDNA ITS and chloroplast rbcL gene[J].Journal of Fisheries of China,2009,33(4):565-571.
Authors:SUN Xue  WU Xiaowei  Li Xingwen and PEI Luqing
Institution:Ningbo University,Ningbo University,Ningbo University,Ningbo University
Abstract:
Keywords:Chlorella  ITS  rbcL  genetic distance  interspecies relationship  intraspecies relationship
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