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中国南海海域斑节对虾群体与西印度洋、西太平洋群体种群遗传结构的比较分析
引用本文:熊小飞,江世贵,夏军红,苏天凤,龚世园.中国南海海域斑节对虾群体与西印度洋、西太平洋群体种群遗传结构的比较分析[J].水产学报,2008,32(6):855-863.
作者姓名:熊小飞  江世贵  夏军红  苏天凤  龚世园
作者单位:1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300;华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300
3. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070
基金项目:国家863高技术发展计划(2006AA10A406)
摘    要:采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚、深圳、湛江、北海4个斑节对虾群体共95个个体的延伸因子1-alpha 内含子序列进行了扩增,对扩增产物进行克隆转化,并将阳性克隆产物进行序列测定,最终获得了大小约216bp的可供分析的核苷酸序列。将获得的序列与从Genbank上下载的西太平洋、西印度洋序列进行比较分析。数据分析结果表明:北太平洋中国海域的基因多样性最低,西太平洋海域基因多样性水平最高;通过对遗传分化指数Fst的分析,发现西太平洋群体和西印度洋群体之间以及两者与北太平洋中国海域群体间遗传分化具有极显著性差异(P < 0.001)。UPGMA系统树显示,10个斑节对虾群体形成两大分支,一支由西太平洋群体和北太平洋中国海域群体组成,另一支由西印度洋群体单独组成;北太平洋中国海域群体中北海群体单独聚成一支。从序列差异的分析中得出,北太平洋中国海域群体与西印度洋群体之间的亲缘关系最远,与西太平洋群体之间的亲缘关系较近;中国海域内部各群体之间,北海群体与海南、深圳、湛江群体之间的亲缘关系较远,形成一个独特的地理种群。

关 键 词:斑节对虾  延伸因子1-alpha  内含子序列  种群结构  遗传多样性
收稿时间:2007/11/12 0:00:00
修稿时间:2008/3/14 0:00:00

Population structure of the black tiger prawn, Penaeus monodon, among the south China sea, western Pacific
Xiong Xiaofei,JIANG Shigui,XIA Junhong,SU Tianfeng and GONG Shiyuan.Population structure of the black tiger prawn, Penaeus monodon, among the south China sea, western Pacific[J].Journal of Fisheries of China,2008,32(6):855-863.
Authors:Xiong Xiaofei  JIANG Shigui  XIA Junhong  SU Tianfeng and GONG Shiyuan
Institution:South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences
Abstract:Polymerase chain reaction(PCR) technique was used to amplify the elongation factor 1-alpha intron sequences region for 95 wild individuals of Penaeus monodon caught from sea waters of Sanya of Hainan,Shenzhen,Zhanjiang and Beihai in the south China Sea.The PCR products were cloned.The electropositive cloned products were sequenced.As a result,about 216 bp nucleotide sequences that could be analysed were obtained(the primer and some of the marginal sequences were excluded).The nucleotide sequences of the bla...
Keywords:Penaeus monodon  elongation factor 1-alpha intron sequence  population structure  genetic diversity
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