首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

笛鲷属线粒体基因组编码序列的系统进化分析能力评估
引用本文:王中铎,谭围,郭昱嵩,刘丽,刘楚吾,刘筠.笛鲷属线粒体基因组编码序列的系统进化分析能力评估[J].水产学报,2010,34(6):656-664.
作者姓名:王中铎  谭围  郭昱嵩  刘丽  刘楚吾  刘筠
作者单位:1. 广东海洋大学水产学院,广东,湛江,524066;湖南师范大学生命科学学院,湖南,长沙,410081;南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室,广东,湛江,524006
2. 广东海洋大学水产学院,广东,湛江,524066;南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室,广东,湛江,524006
3. 湖南师范大学生命科学学院,湖南,长沙,410081
基金项目:国家“十一五”科技支撑计划项目(2007BAD29B03);国家自然科学基金项目(30972253)
摘    要:运用通用引物长距PCR(Long-PCR)和常规PCR相结合的方法测定了鲈形目笛鲷科的4种笛鲷属鱼类(孟加拉笛鲷、四带笛鲷、千年笛鲷和马拉巴笛鲷)和军曹鱼科的军曹鱼线粒体DNA基因组全序列(GenBank序列号分别为FJ171339,FJ416614,FJ824741,FJ824742 和NC_011219),得出所用全序列测定体系的方法通用性较强,操作简单。线粒体基因组的比对分析表明,测定的mtDNA基因组的绝大部分区段与GenBank中现有的脊椎动物的序列有较高的同源性。以军曹鱼外群结合GenBank中近缘笛鲷鱼类(勒氏笛鲷、蓝点笛鲷和黑带鳞鳍梅鲷)进行的聚类分析中,勒氏笛鲷与黑带鳞鳍梅鲷的聚类关系近于同属物种,与形态学分类存在矛盾。通过单个基因和基因拼接序列比较,综合考虑邻位连接法构建系统进化树的置信度和序列的信息量,对13种蛋白质编码基因在属内种间的系统进化分析能力进行了评估,将基因分成不同的4等:很好的为ATPase6cox2;好的序列为ND2cox1;差的为ND6、ND3ATPase8;包括Cyt b在内的其余6种基因为中等。分析还揭示出序列长度的增加可以提高系统进化树的置信度,且属内物种间比较时序列长度的影响小于高级阶元。

关 键 词:笛鲷属    线粒体基因组    分子系统进化
收稿时间:2010/1/13 0:00:00
修稿时间:2010/3/29 0:00:00

Performance of mitogenomic coding regions within genus Lutjanus molecular phylogenetics
WANG Zhong-duo,TAN Wei,GUO Yu-song,LIU Li,LIU Chu-wu,LIU Yun.Performance of mitogenomic coding regions within genus Lutjanus molecular phylogenetics[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(6):656-664.
Authors:WANG Zhong-duo  TAN Wei  GUO Yu-song  LIU Li  LIU Chu-wu  LIU Yun
Institution:GUANGDONG OCEAN UNIVERSITY
Abstract:
Keywords:Lutjanus  mitogenome  phylogenetics
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《水产学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号