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凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析
引用本文:赵永贞,陈秀荔,谢达祥,王大鹏,彭敏,杨春玲,杨彦豪,韦嫔媛,陈晓汉.凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析[J].水产学报,2010,34(11):1681-1688.
作者姓名:赵永贞  陈秀荔  谢达祥  王大鹏  彭敏  杨春玲  杨彦豪  韦嫔媛  陈晓汉
作者单位:广西水产研究所,广西水产动物遗传育种与健康养殖重点实验室,广西,南宁,530021
基金项目:国家科技支撑计划项目(2007BAD29B01,2006BAD01A13,2008BADB9B03); 桂科基(0836028)
摘    要:克隆了凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白基因全长cDNA并进行了序列分析。该基因由1042bp的碱基组成,开放阅读框长411bp,编码由136个氨基酸组成的蛋白,基因两翼分别存在113bp(5'端)和518bp(3'段)的非翻译区。聚类分析表明,凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白氨基酸序列与斑节对虾脂肪酸结合蛋白紧密聚为一支,之后聚类顺序依次为刀额新对虾、意大利蜜蜂、斑马鱼、大西洋鲑、鸡、猪和人。通过半定量RT-PCR对该基因在不同组织的表达分析表明,该基因在抗IHHNV对虾肠、胃、肝胰腺和肌肉组织中表达较高,在心肌中表达较低,在眼柄中不表达。比较该基因在抗IHHNV对虾和IHHNV易感对虾心、肝胰腺、肠、胃、眼柄和肌肉组织表达发现,该基因在两种对虾心、肠、胃和肌肉组织中的表达无明显差异,但在肝胰腺中抗IHHNV对虾的表达量明显高于IHHNV易感对虾的表达量,说明该基因参与抗性对虾抑制IHHNV感染的免疫过程。

关 键 词:凡纳滨对虾  脂肪酸结合蛋白  基因克隆  对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒  
收稿时间:2010/6/11 0:00:00
修稿时间:2010/7/18 0:00:00

Cloning and analysis of full length cDNA of intracellular fatty-acid-binding protein in Litopenaeus vannamei
ZHAO Yong-zhen,CHEN Xiu-li,Xie Da-xiang,WANG Da-peng,PENG Min,YANG Chun-ling,YANG Yan-hao,WEI Ping-Yuan and CHEN Xiao-han.Cloning and analysis of full length cDNA of intracellular fatty-acid-binding protein in Litopenaeus vannamei[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(11):1681-1688.
Authors:ZHAO Yong-zhen  CHEN Xiu-li  Xie Da-xiang  WANG Da-peng  PENG Min  YANG Chun-ling  YANG Yan-hao  WEI Ping-Yuan and CHEN Xiao-han
Institution:ZHAO Yong-zhen,CHEN Xiu-li,XIE Da-xiang,WANG Da-peng,PENG Min,YANG Chun-ling,YANG Yan-hao,WEI Pin-yuan,CHEN Xiao-han (The Key Laboratory of Aquatic Genetic Breeding and Health Cultivation of Guangxi,Guangxi Institute of Fisheries,Nanning 530021,China)
Abstract:Full-length cDNA sequence of fatty acid-binding protein was isolated from hepatopancreas of Litopenaeus vannamei.The full-length cDNA sequence of fatty acid-binding protein is 1 042 bp,which contains a 113 bp 5'-UTR(untranslated region) ,518 bp 3'-UTR(untranslated region) ,and 411 bp open reading frame (ORF) that encodes 136 amino acid residues.There are typical fatty acid-binding protein domains between 4-26 and 63-79 amino acids residues of Litopenaeus vannamei FABP(LvFABP) ,and these sequences highly con...
Keywords:Litopenaeus vannamei  fatty acid-binding protein  gene cloning  infectious hypodermal & haematopoietic necrosis virus  
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