| 中间球海胆Y-box基因分子特性和表达分析 |
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| 引用本文： | 田燚,张丙龙,常亚青,董萍萍.中间球海胆Y-box基因分子特性和表达分析[J].水产学报,2013,37(3):376-389. |
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| 作者姓名： | 田燚 张丙龙 常亚青 董萍萍 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室,辽宁大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究规划项目;高等学校博士学科点专项科研基金 |
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| 摘 要： | 为获得Y-box蛋白在中间球海胆的生物学功能,实验克隆了中间球海胆Y-box基因的全长cDNA,并进行了定量表达模式分析.Y-box基因全长cDNA为2 425 bp,该序列具有一个81 bp的5’非编码区,1 348 bp 3’非编码区,ORF为996 bp,cDNA编码331个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为37.4 ku,理论等电点是8.55,属于亲水性蛋白.中间球海胆Y-box前体蛋白的氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,亲水结构域C末端和冷休克结构域(cold shock domain CSD),其中CSD区为Y-box蛋白家族中保守结构域.海胆Y-box蛋白质二级结构中无规则卷曲占88.22％,延伸链占9.97％,α-螺旋1.98％,无β-折叠.氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性为22.37％～41.26％,在保守结构域CSD区同源性达到75％以上.实时定量PCR检测,Y-box基因在中间球海胆体腔液、管足、围口膜、雄性性腺、雌性性腺、肌肉和肠7个不同组织中均有表达,但差异不显著.温度胁迫下,中间球海胆Y-box基因的表达均表现为下调,并且随着温度的升高,Y-box基因的表达量呈现逐渐下降的趋势.
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| 关 键 词： | 海胆 Y-box基因 克隆 表达 |
| 收稿时间： | 2012/8/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/12/12 0:00:00 |
Molecular characteristic and expression analysis of Y-box gene from sea urchin Strongylocentyotus internedius |
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| TIAN yi,ZHANG binglong,CHANG yaqing and DONG pingping.Molecular characteristic and expression analysis of Y-box gene from sea urchin Strongylocentyotus internedius[J].Journal of Fisheries of China,2013,37(3):376-389. |
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| Authors: | TIAN yi ZHANG binglong CHANG yaqing and DONG pingping |
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| Institution: | Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University,Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University,Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University,Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sea urchin Y-box gene cloning bioinformatics analysis gene expression |
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