首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

赤眼鳟LGP2序列结构、组织表达及与MDA5互作特征
引用本文:李耀国,廖依静,王静安,肖调义.赤眼鳟LGP2序列结构、组织表达及与MDA5互作特征[J].水产学报,2024,48(1):019403-019403.
作者姓名:李耀国  廖依静  王静安  肖调义
作者单位:湖南农业大学, 湖南省特色水产资源利用工程技术研究中心, 湖南 长沙 410128
基金项目:国家自然科学基金 (32172966,31802288,U20A2063);湖南省教育厅资助科研项目(19B265);中央引导地方科技发展资金(2022ZYC085)
摘    要:为探究赤眼鳟遗传学和生理学实验室蛋白2 (laboratory of genetics and physiology 2, LGP2)的功能特征及抗草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus, GCRV)育种参考潜力,实验克隆获得了2 940 bp的赤眼鳟lgp2 (Sclgp2)全长cDNA和721 bp的5′端上游序列。Sclgp2 cDNA编码680个氨基酸,包含DEXDc (DExD/H-box helicase domain)、HELICc (helicase superfamily C-terminal domain)和CTD (C-terminal regulatory domain)结构域;其5′端上游序列含有MafB (muscle aponeurosis fibromatosis B)和IRF3 (interferon regulatory factor 3)等转录因子结合位点。不同物种LGP2的功能结构域、磷酸化修饰位点数具有相似性,同时也存在结构域排布位置及序列的差异。赤眼鳟和草鱼lgp2 cDNA序列比较初步发现2个位于RNA结合功能区的GCRV抗性关联位点。系统进化分析显示,赤眼鳟LGP2先与草鱼、鲫和青鱼聚在一起,再与鲤科鱼类等聚为一大支。荧光定量表达分析显示,赤眼鳟脾脏中sclgp2表达水平显著高于其他组织,肌肉、心脏中表达量次之,而肠中表达量最低。GCRV感染后,肝脏中ifn1表达水平在24~72 h显著下降,其他组织sclgp2和ifn1表达水平未有显著变化。相关性分析结果显示,赤眼鳟肌肉sclgp2与ifn1表达水平呈极显著正相关(0.999)。酵母双杂交互作检测发现,赤眼鳟LGP2与MDA5存在弱相互作用,而其DEXDc (1~201 aa)、HELICc (390~476 aa)以及CTD (553~668 aa)结构域与MDA5无互作。该研究成功获得了sclgp2全长cDNA及5′端上游序列,明确了其序列结构、免疫表达及与MDA5的互作特征,为赤眼鳟LGP2免疫功能属性研究奠定了基础,并为草鱼抗GCRV育种提供了参考。

关 键 词:赤眼鳟  生理学实验室蛋白2  (LGP2)  序列结构  表达特征  蛋白互作  GCRV抗性
收稿时间:2021/10/11 0:00:00
修稿时间:2022/4/2 0:00:00

Sequence structure, tissue expression of LGP2, and its interaction with MDA5 in Squaliobarbus curriculus
LI Yaoguo,LIAO Yijing,WANG Jing''an,XIAO Tiaoyi.Sequence structure, tissue expression of LGP2, and its interaction with MDA5 in Squaliobarbus curriculus[J].Journal of Fisheries of China,2024,48(1):019403-019403.
Authors:LI Yaoguo  LIAO Yijing  WANG Jing'an  XIAO Tiaoyi
Institution:Hunan Engineering Technology Research Center of Featured Aquatic Resources Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China
Abstract:
Keywords:Squaliobarbus curriculus  laboratory of genetics and physiology 2  sequence structure  expression characteristic  protein interaction  GCRV resistance
点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《水产学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号