| 三疣梭子蟹型微卫星标记的发掘及多态性分析 |
| |
| 引用本文： | 吕建建,王渝,高保全,李健,刘萍.三疣梭子蟹型微卫星标记的发掘及多态性分析[J].水产学报,2013,37(6):816-822. |
| |
| 作者姓名： | 吕建建 王渝 高保全 李健 刘萍 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛,266071
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 |
| |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划 |
| |
| 摘 要： | 为发掘三疣梭子蟹Ⅰ型微卫星标记,实验运用生物信息学方法,从NCBI数据库已公开的13 985条三疣梭子蟹EST序列中搜索微卫星位点.结果显示,共搜索到287个微卫星位点,其中主要为二核苷酸重复序列(173个),占总数的60.3％；其次为三核苷酸重复序列(79个),占总数的27.5％；四、五、六核苷酸重复位点较少；在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的53.8％,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的37.0％,AT和GC重复较少.挑选14个Ⅰ型微卫星标记在野生三疣梭子蟹群体中进行多态性检测,发现8个位点呈多态性,平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.57和0.63.其中6个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现较高多态性特征.研究表明,基于三疣梭子蟹EST数据发掘Ⅰ型微卫星标记的方法切实可行.本研究发掘的Ⅰ型微卫星标记将为三疣梭子蟹遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的分子标记.
|
| 关 键 词： | 三疣梭子蟹 微卫星标记 多态信息含量 |
| 收稿时间： | 2012/9/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/3/21 0:00:00 |
Identification of type Ⅰ microsatellite markers and their polymorphism in Portunus trituberculatus |
| |
| lvjianjian,Wangyu,Gaobaoquan,Lijian and Liuping.Identification of type Ⅰ microsatellite markers and their polymorphism in Portunus trituberculatus[J].Journal of Fisheries of China,2013,37(6):816-822. |
| |
| Authors: | lvjianjian Wangyu Gaobaoquan Lijian and Liuping |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Portunus trituberculatus Microsatellite Polymorphism Information Content (PIC) |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《水产学报》下载免费的PDF全文 |
|
