| 三角帆蚌钙网蛋白基因cDNA的分子特征与表达分析 |
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| 引用本文： | 夏秀琳,汪桂玲,白志毅,李家乐.三角帆蚌钙网蛋白基因cDNA的分子特征与表达分析[J].水产学报,2013,37(5):679-687. |
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| 作者姓名： | 夏秀琳 汪桂玲 白志毅 李家乐 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海,201306
2. 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海201306;上海市高校水产养殖学E研究院,上海海洋大学,上海201306 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31101939);上海市科委基础研究重点项目(10JC1406300);上海市教委科研创新重点项目(13ZZ128);上海市高校知识服务平台项目(ZF1206) |
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| 摘 要： | 为研究淡水珍珠形成相关基因及调控机理,以三角帆蚌为研究对象,借助cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得了三角帆蚌的钙网蛋白基因(calreticulin,HcCRT) cDNA序列,该序列长1 437 bp,包含231 bp的5'非编码区(untranslated region,UTR)和615 bp 3'UTR以及591bp的开放阅读框(ORF),共编码196个氨基酸残基,包含一段由21个氨基酸组成的信号肽和一段由175个氨基酸的成熟肽,分子量约为22.4 ku,理论等电点5.01.氨基酸序列分析表明,该序列不存在跨膜结构,疏水性分析显示该蛋白整体为亲水性蛋白.氨基酸列比对分析显示,HcCRT具有保守的钙网蛋白家族结构,具有2个保守的钙网蛋白家族标签序列:KHEQNIDCGGGYLKVF和IMFGPDICG,与其他已知物种的CRT具有较高保守性,其中与斑马鱼的相似度为77％,与长牡蛎和马氏珠母贝的相似度为70％.对三角帆蚌HcCRT蛋白序列的二级结构和三级结构进行预测分析,显示该蛋白同时含螺旋和折叠.实时荧光定量PCR分析结果显示,HcCRT在外套膜、血液、鳃、斧足、肝脏、肾脏、肠和闭壳肌等8个组织中均有表达,其中在外套膜中表达量最高,血液次之,在其他组织的表达量极少.初步推测HcCRT参与了三角帆蚌珍珠形成的生物矿化过程.
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| 关 键 词： | 三角帆蚌 钙网蛋白 分子特征 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2012/11/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2/8/2013 12:00:00 AM |
Molecular characterization and expression analysis of calreticulin cDNA from Hyriopsis cumingii |
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| XIA Xiulin,WANG Guiling,BAI Zhiyi and LI Jiale.Molecular characterization and expression analysis of calreticulin cDNA from Hyriopsis cumingii[J].Journal of Fisheries of China,2013,37(5):679-687. |
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| Authors: | XIA Xiulin WANG Guiling BAI Zhiyi and LI Jiale |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hyriopsis cumingii calreticulin molecular characterization real-time quantitative PCR |
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