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| 脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选 | |
| 引用本文： | 贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青.脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J].水产学报,2011,35(12):1787-1794. |
| 作者姓名： | 贾舒雯 刘萍 韩智科 李健 潘鲁青 |
| 作者单位： | 1. 中国海洋大学水产学院,山东青岛266003;中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071 2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛,266071 3. 中国海洋大学水产学院,山东青岛,266003 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30871933,40806067);科技部农业科技成果转化资金项目(2010GB23260589) |
| 摘 要： | 采用人工合成的生物素标记(AG)15探针及磁珠富集法构建了脊尾白虾基因组微卫星富集文库.将脊尾白虾基因组DNA经HaeⅢ酶切后,收集400 ～1 200 bp片段,连接特定接头,与生物素标记(AG)15探针杂交并捕获含有微卫星的DNA片段,然后连接到pMD18-T载体中,构建脊尾白虾微卫星富集文库.随机挑取947个克隆,经菌落PCR检验,其中667个为阳性克隆.从阳性克隆中随机选取184个克隆进行测序,有150个克隆含有微卫星序列,共获得199个微卫星序列,其中完美型158个(79.4％),非完美型27个(13.6％),复合型14个(7.0％).根据微卫星序列,设计了119对微卫星引物,64对扩增出稳定的具有特异性的条带,经30个脊尾白虾个体进行多样性评价后,有26个位点表现出多态性.26个微卫星位点获得的等位基因数从3 ～ 16个不等,平均每个位点扩增得到6.5个等位基因.观测杂合度(Ho)、期望杂合度(4)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.111 ～ 0.929、0.246 ～0.932、0.231 ～0.909.本研究开发的微卫星位点将为脊尾白虾种群多样性研究、家系识别和种质鉴定提供有效的工具. |
| 关 键 词： | 脊尾白虾 富集文库 微卫星标记 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 7/6/2011 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2011/9/27 0:00:00 |
Construction of microsatellite-enriched library and isolation of microsatellite markers in the ridgetail white prawn(Exopalaemon carinicauda) |
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| JIA Shu wen,LIU Ping,HAN Zhi ke,LI Jian and PAN Lu qing.Construction of microsatellite-enriched library and isolation of microsatellite markers in the ridgetail white prawn(Exopalaemon carinicauda)[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(12):1787-1794. | |
| Authors: | JIA Shu wen LIU Ping HAN Zhi ke LI Jian and PAN Lu qing |
| Institution: | Ocean University of China,Qingdao;Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao,Ocean University of China,Qingdao |
| Abstract: | |
| Keywords: | Exopalaemon carinicauda magnetic bead hybridization enrichment microsatellite population genetic diversity |
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