| 海带cbbX基因序列特征及在雌、雄配子体之间的差异表达 |
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| 引用本文： | 石微微,王丽丽,陈晶,欧阳珑玲,周志刚.海带cbbX基因序列特征及在雌、雄配子体之间的差异表达[J].水产学报,2010,34(1):80-88. |
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| 作者姓名： | 石微微 王丽丽 陈晶 欧阳珑玲 周志刚 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海市高校水产养殖学E-研究院,上海,201306
2. 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海市高校水产养殖学E-研究院,上海,201306;国家海洋局海洋环境监测中心,辽宁,大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30471328,30671627); 上海市教育委员会海洋生物学重点学科资助项目(J50701) |
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| 摘 要： | 根据海带雄配子体抑制消减cDNA文库中筛选出的克隆18序列设计基因特异性引物,利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),克隆了一条长2087bp的cDNA序列(GenBank登陆号:EF490312),其中开放阅读框1275bp,5′-非翻译区(untranslated region,UTR)长118bp,3′-UTR长694bp且具有明显的polyA尾巴。蛋白同源搜索显示,它编码的蛋白与Guillardiatheta这种隐藻核型体编码的CbbX蛋白(GenBank登录号:CAB65663)具有66%同源性。推测的海带配子体cbbX基因编码一个含有424个氨基酸的前体蛋白,前19个氨基酸为信号肽序列。酶切后的成熟蛋白由405个氨基酸组成,分子量为45.26ku,等电点为5.28。海带配子体cbbX基因被8个内含子隔离开,它们的剪切位点都遵循GT-AG规则。无论在cDNA或者DNA序列上,雌、雄配子体cbbX基因都没有差异。自编码蛋白的第184位Gly开始,具有一个典型的Walker ATP-结合motif。通过与其它物种共14个CbbX蛋白序列...
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| 关 键 词： | 海带 配子体 cbbX基因 核甘酸序列 转录 |
| 收稿时间： | 5/9/2009 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2009/7/21 0:00:00 |
Cloning and characterization of a cbbX gene from the gametophytes of Laminaria japonica |
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| SHI Wei-wei,Wang Lili,Chen jing,OUYANG Ling-long and Zhou Zhigang.Cloning and characterization of a cbbX gene from the gametophytes of Laminaria japonica[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(1):80-88. |
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| Authors: | SHI Wei-wei Wang Lili Chen jing OUYANG Ling-long and Zhou Zhigang |
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| Institution: | SHI Wei-wei1,WANG Li-li1,2,CHEN Jing1,OUYANG Long-ling1,ZHOU Zhi-gang1 (1. Key Laboratory of Genetic Resources , Their Applications in Aquaculture,, Aquaculture E-Institute of Shanghai Municipal Education Commission,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China,2. National Marine Environmental Monitoring Centre,State Oceanic Administration,Dalian 116023,China) |
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| Abstract: | With designed gene-specific primers on basis of Clone 18 sequence screened out of a suppressive subtracted cDNA library from the male gametophyte of Laminaria japonica,a full length cDNA (GenBank accession No:EF490312) was cloned by use of rapid amplification of cDNA ends (RACE). It was composed of 2087 bp in length including 118 bp 5'-untranslated region (UTR),694 bp 3'-UTR with poly A at this end and 1 275 bp open reading frame (ORF). Its homology with Guillardia theta nucleomorph-encoding CbbX protein (G... |
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