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壬基酚致红鲫发育畸形的机制
引用本文:田雨苏,孙远东,欧密,刘雨芳,崔小娟,周定港,车文安,陈昆慈.壬基酚致红鲫发育畸形的机制[J].水产学报,2020,44(10):1619-1636.
作者姓名:田雨苏  孙远东  欧密  刘雨芳  崔小娟  周定港  车文安  陈昆慈
作者单位:湖南科技大学生命科学学院,湖南 湘潭 411201;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380
基金项目:国家重点研发计划(2017YFD0200400);湖南省教育厅重点项目(17A072);农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室开放课题基金
摘    要:壬基酚(nonylphenol,NP)是广泛存在于水体中的环境内分泌干扰物,对生物体的生长发育造成影响。为了探究壬基酚致红鲫发育畸形的机制,本研究以红鲫为研究对象,采用Illumina HiSep 2500对正常神经胚期胚胎(NC)、正常21体节期胚胎(SC)和暴露5 μmol/L NP中发育畸形的神经胚期胚胎(NNP)、畸形21体节期胚胎(SNP)进行转录组测序(RNA-seq),并结合实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达基因(differential expression gene, DEG)。RNA-seq共得到89 166条高质量unigenes,其中30 319条unigenes获得注释结果。NC、SC、NNP和SNP两两比较分析发现,NC/NNP中DEGs 153个,SC/SNP中DEGs 10个,NC/SC中DEGs 6 121个,NNP/SCP中DEGs 7 270个。KEGG分析发现,上述DEGs多数聚集在细胞过程、环境信息处理和新陈代谢通路上。利用qRT-PCR验证了生长、发育、细胞骨架及心血管循环相关的25个DEGs,它们的表达变化在qRT-PCR和RNA-seq中结果一致,一方面说明了RNA-seq结果可靠,另一方面初步挖掘出NP胁迫致红鲫胚胎发育畸形的候选基因,为后续深入探讨NP致畸的分子机制研究提供前期数据。

关 键 词:红鲫胚胎  壬基酚  转录组测序  荧光定量PCR
收稿时间:2019/9/30 0:00:00
修稿时间:2020/1/1 0:00:00

Preliminary studies on the mechanism of nonylphenol-induced malformation of Carassius auratus red var.
Tian Yusun,Sun Yuandong,Ou Mi,Cui Xiaojuan,Zhou Dingguang and Che Wenan.Preliminary studies on the mechanism of nonylphenol-induced malformation of Carassius auratus red var.[J].Journal of Fisheries of China,2020,44(10):1619-1636.
Authors:Tian Yusun  Sun Yuandong  Ou Mi  Cui Xiaojuan  Zhou Dingguang and Che Wenan
Institution:School of Life Sciences, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan 411201, China;Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fishery Resources Application and Cultivation, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510380, China
Abstract:
Keywords:
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