| 脊尾白虾线粒体基因组应答饥饿的甲基化特征分析 |
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| 引用本文： | 高焕,赵莲,薛蓓,朱国华,赖晓芳,陈建华,申欣,阎斌伦.脊尾白虾线粒体基因组应答饥饿的甲基化特征分析[J].水产学报,2015,39(7):953-961. |
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| 作者姓名： | 高焕 赵莲 薛蓓 朱国华 赖晓芳 陈建华 申欣 阎斌伦 |
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| 作者单位： | 江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心, 江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台, 江苏 南京 210014,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心, 江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台, 江苏 南京 210014,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心, 江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台, 江苏 南京 210014,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心, 江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台, 江苏 南京 210014,江苏省海洋生物技术重点实验室, 淮海工学院, 江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心, 江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台, 江苏 南京 210014 |
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| 基金项目： | 江苏省农业科技支撑计划(BE2013363);江苏省高校“青蓝工程”培养基金;江苏省优势学科建设工程专项(KYCX07) |
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| 摘 要： | 为研究脊尾白虾应答饥饿的线粒体基因组表观遗传学特征,本研究在筛选适宜脊尾白虾线粒体基因组甲基化位点分析的BSP引物基础上,对不同饥饿期该虾线粒体基因组的甲基化特征进行了分析。共设计覆盖脊尾白虾线粒体全基因组序列的BSP引物51对,经验证其中10对引物可用于脊尾白虾线粒体基因组的甲基化特征分析,选用其中具有稳定扩增产物的5对引物分别对饥饿10、20和30 d的脊尾白虾线粒体基因组的甲基化特征进行了分析,结果表明,脊尾白虾耐受饥饿的平均死亡时间为19.8 d,最长耐受时间为48 d,在不同饥饿阶段线粒体基因组均可发生甲基化现象,且在第10天时甲基化比例最高,而第20和30天时甲基化比例反而降低;甲基化主要发生在ND基因位点上,据此推测这种甲基化可能用来调节能量代谢相关的电子传递链过程。本研究首次揭示了脊尾白虾线粒体基因组存在甲基化现象,为展开虾类线粒体基因组表观遗传学研究奠定了理论基础。
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| 关 键 词： | 脊尾白虾 线粒体基因组 甲基化 饥饿 |
| 收稿时间： | 2014/12/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/2/17 0:00:00 |
Analysis of methylation profile in mitochondrial genome of Exopalaemon carinicauda in response to starvation |
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| GAO Huan,ZHAO Lian,XUE Bei,ZHU Guohu,LAI Xiaofang,CHEN Jianhu,SHEN Xin and YAN Binlun.Analysis of methylation profile in mitochondrial genome of Exopalaemon carinicauda in response to starvation[J].Journal of Fisheries of China,2015,39(7):953-961. |
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| Authors: | GAO Huan ZHAO Lian XUE Bei ZHU Guohu LAI Xiaofang CHEN Jianhu SHEN Xin and YAN Binlun |
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| Institution: | Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China;Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Lianyungang 222001, China;The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China;Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Lianyungang 222001, China;The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China;Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Lianyungang 222001, China;The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China;Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Lianyungang 222001, China;The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China and Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Huaihai Institute of Technology, Lianyungang 222005, China;Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Lianyungang 222001, China;The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Exopalaemon carinicauda mitochondrial genome methylation starvation |
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