| 鲫和鳜主要过敏原小清蛋白的基因克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 阮密密,蔡秋凤,刘光明,曾伶俐,苏文金,曹敏杰.鲫和鳜主要过敏原小清蛋白的基因克隆及序列分析[J].水产学报,2012,36(11):1650-1657. |
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| 作者姓名： | 阮密密 蔡秋凤 刘光明 曾伶俐 苏文金 曹敏杰 |
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| 作者单位： | 集美大学生物工程学院;集美大学生物工程学院;集美大学生物工程学院;集美大学生物工程学院;集美大学生物工程学院;集美大学生物工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31071519); 福建省自然科学基金项目(2010J01044, 2010J06012); 集美大学科研基金(ZQ2011011) |
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| 摘 要： | 小清蛋白(parvalbumin, PV)是鱼类的主要过敏原, 为分析淡水鱼PV的序列及结构特征,采用RT-PCR方法, 从鲫和鳜肌肉中分别克隆得到2种小清蛋白的基因序列。生物信息学分析结果显示, 4种基因的序列长度均为330 bp, 编码109个氨基酸残基, 推导分子量在11.6 ku左右, 等电点为4.45~4.69。氨基酸序列分析表明, 克隆得到的这4种PV序列均含有丙氨酸-14、亮氨酸-16、半胱氨酸-19、苯丙氨酸-67、谷氨酰胺-69以及苏氨酸-79等β型PV特征性残基序列, 表明克隆的目的基因均为β型PV。鲫的2种PV序列相似性为80.73 %, 鳜的2种PV的序列相似性为83.49 %。对克隆得到的PV序列进行空间结构分析显示, 这4种PV序列均含有3个螺旋-松弛-螺旋结构, 即EF-手型结构, 其中靠近C端功能域的两个手型结构为Ca2﹢结合位点。
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| 关 键 词： | 鲫 鳜 小清蛋白 基因克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2011/12/23 0:00:00 |
| 修稿时间： | 9/7/2012 12:00:00 AM |
Molecular cloning and sequences analysis of parvalbumin gene in crucian carp and mandarin fish |
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| RUAN Mi-mi,CAI Qiu-feng,LIU Guang-ming,ZENG Ling-li,SU Wen-jin and CAO Min-jie.Molecular cloning and sequences analysis of parvalbumin gene in crucian carp and mandarin fish[J].Journal of Fisheries of China,2012,36(11):1650-1657. |
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| Authors: | RUAN Mi-mi CAI Qiu-feng LIU Guang-ming ZENG Ling-li SU Wen-jin and CAO Min-jie |
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| Keywords: | Carassius auratus Siniperca chuatsi parvalbumin molecular cloning sequence analysis |
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