| 富集文库－菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记 |
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| 引用本文： | 战爱斌,胡景杰,胡晓丽.富集文库－菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记[J].水产学报,2008,32(3):353-361. |
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| 作者姓名： | 战爱斌 胡景杰 胡晓丽 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003 |
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| 基金项目： | 国家支撑计划项目
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科技部科技基础条件平台建设计划
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国家农业科技成果转化基金 |
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| 摘 要： | 应用微卫星富集文库─菌落原位杂交法,筛选得到了40个栉孔扇贝的微卫星标记.用固定了(AG)15和(AC)15探针的尼龙膜(Hybond N )捕捉含有微卫星DNA的片段,经洗脱、PCR扩增和TA克隆,构建栉孔扇贝的微卫星富集文库.利用ECL试剂盒(Amersham公司)标记的(AG)15和(AC)15探针进行菌落原位杂交筛选微卫星富集文库,阳性克隆经测序获得微卫星DNA.富集文库中1200个重组克隆经过菌落原位杂交后,532个(44.3%)为阳性克隆.任意挑选100个克隆测序,结果显示所有的克隆都至少含有一个微卫星位点.利用软件设计了65对特异性PCR引物,40对能扩增出清晰的带谱;利用48个栉孔扇贝个体评价微卫星位点,分析表明37个位点具有多态性.不同的位点获得的等位基因数目为2～14个不等,37个多态性位点共获得258个等位基因,平均每个位点获得7.0个等位基因.观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.1000～1.0000、0.1197～0.9831和0.1172～0.9782.结果表明,富集文库─菌落原位杂交法适合大规模筛选目标物种的微卫星标记.
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| 关 键 词： | 栉孔扇贝 富集文库 菌落原位杂交 微卫星标记 多态性 富集文库 菌落原位杂交 原位杂交法 筛选 栉孔扇贝 微卫星标记 library screening microsatellite markers characterization 目标物 大规模 范围 量值 信息 期望 杂合度 观测 等位基因 多态性位点 |
| 文章编号： | 1000-0615(2008)03-0353-09 |
| 收稿时间： | 5/9/2008 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 5/9/2008 12:00:00 AM |
Isolation and characterization of microsatellite markers for Zhikong scallop by screening SSR-enriched library |
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| ZHAN Aibin,Hu Jingjie and Hu Xiaoli.Isolation and characterization of microsatellite markers for Zhikong scallop by screening SSR-enriched library[J].Journal of Fisheries of China,2008,32(3):353-361. |
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| Authors: | ZHAN Aibin Hu Jingjie and Hu Xiaoli |
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| Institution: | Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Sciences, Ocean University of China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chlamys farreri enrichment library screening colony hybridization microsatellite markers polymorphism |
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