| 达氏鳇肌肉组织转录组测序和功能分析 |
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| 引用本文： | 赵文,高峰英,石振广.达氏鳇肌肉组织转录组测序和功能分析[J].水产学报,2014,38(9):1255-1262. |
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| 作者姓名： | 赵文 高峰英 石振广 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学辽宁省水生生物学重点实验室, 辽宁 大连 116023;大连海洋大学辽宁省水生生物学重点实验室, 辽宁 大连 116023;云南阿穆尔鲟鱼集团有限公司, 云南 昆明 050228 |
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| 基金项目： | 横向联合项目“达氏鳇基础生物学研究”（2012-2014） |
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| 摘 要： | 为发掘达氏鳇的功能基因,采用新一代高通量测序技术对达氏鳇肌肉组织转录组进行测序。结果获得原始数据14 447 211 200 bp,拼接获得了55 531条单基因序列(unigene),长度范围300~32 613 bp,平均长度941 bp。利用生物信息学方法对unigene进行了非冗余蛋白质数据库(Nr)相似搜索,此外还进行了GO的功能注释和KEGG代谢通路分析。结果一共有20 735条unigene(37.34%)与Nr数据库中的己知基因同源;根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56分支;依据KEGG代谢通路分析可以分成290类。
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| 关 键 词： | 达氏鳇 肌肉组织 基因 转录组 |
| 收稿时间： | 3/7/2014 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2014/6/25 0:00:00 |
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