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| 湖鲚体内与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析 | |
| 引用本文： | 聂志娟,徐钢春,程起群,杜富宽,张勇,顾若波,朱文龙.湖鲚体内与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析[J].淡水渔业,2015(1):8-14. |
| 作者姓名： | 聂志娟 徐钢春 程起群 杜富宽 张勇 顾若波 朱文龙 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心，农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室，江苏无锡 214081 2. 中国水产科学研究院东海水产研究所，农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室，上海 200090 3. 南京农业大学渔业学院,江苏无锡,214081 4. 江阴市周庄镇农服中心,江苏无锡,214423 |
| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2013JBFT04)；农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室开放课题；国家科技支撑计划项目(2012BAD26B05)；公益性行业科研专项 |
| 摘 要： | 利用PCR-DGGE技术,选择细菌原核通用引物F357-GC和R518对太湖湖鲚(Coilia ectenes taihuensis)鳃、肠壁及肠内容物及其生长环境菌群结构进行了初步分析。结果显示:PCR-DGGE指纹图谱分离显示49条清晰条带,样品菌群丰富度(DGGE条带数):湖水(33)肠道壁(23)湖泥(18)肠道内容物(16)=鳃(16);相应的香农多样性指数分别为:3.11、2.76、2.21、2.37、2.30。湖鲚肠道壁、肠道内容物和鳃与湖水分别具有14、14、10条共有带,切胶回收测定其中21条优势条带,主要包含:变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)、柔膜菌(Tenericutes)、蓝藻细菌(Cyanobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)。结果表明PCR-DGGE指纹图谱能够清晰显示湖鲚不同部位及其生长环境细菌群落结构和区分其菌群结构差异,并阐明生长水域环境是影响湖鲚体内细菌菌群结构组成的主要因素之一。 |
| 关 键 词： | 湖鲚(Coilia ectenes taihuensis) PCR-DGGE 细菌群落 香农多样性指数 |
Fingerprint and diversity analysis of the predominant bacterial community in Coilia ectenes taihuensis and its growing environment with PCR-DGGE |
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| NIE Zhi-juan,XU Gang-chun,CHENG Qi-qun,DU Fu-kuan,ZHANG Yong,GU Ruo-bo,ZHU Wen-long.Fingerprint and diversity analysis of the predominant bacterial community in Coilia ectenes taihuensis and its growing environment with PCR-DGGE[J].Freshwater Fisheries,2015(1):8-14. | |
| Authors: | NIE Zhi-juan XU Gang-chun CHENG Qi-qun DU Fu-kuan ZHANG Yong GU Ruo-bo ZHU Wen-long |
| Institution: | NIE Zhi-juan;XU Gang-chun;CHENG Qi-qun;DU Fu-kuan;ZHANG Yong;GU Ruo-bo;ZHU Wen-long;Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Resources Utilization,Ministry of Agriculture/Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Sciences;Key and Open Laboratory of Marine and Estuarine Fisheries Resources and Ecology,Ministry of Agriculture /East China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences;College of Fisheries,Nanjing Agriculture University;Agricultural Service Center of Zhouzhuang; |
| Abstract: | |
| Keywords: | PCR-DGGE Coilia ectenes taihuensis bacterial community shannon diversity index |
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