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干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究
引用本文:丁国华,#,孙健,#,杨光,张凤鸣,白良明,孙世臣,姜树坤,王彤彤,郑洪亮,夏天舒,沈希宏,马殿荣,陈温福.干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究[J].中国水稻科学,2016,30(5):458-468.
作者姓名:丁国华  #  孙健  #  杨光  张凤鸣  白良明  孙世臣  姜树坤  王彤彤  郑洪亮  夏天舒  沈希宏  马殿荣  陈温福
作者单位:1. 黑龙江省农业科学院博士后科研工作站/黑龙江省农业科学院 耕作栽培研究所/中国科学院 北方粳稻分子育种联合研究中心, 哈尔滨 155086;;2. 沈阳农业大学 水稻研究所, 沈阳110866; ;3.辽宁省经济作物研究所, 辽宁 辽阳 111000; ;4.中国水稻研究所, 杭州 310006
基金项目:黑龙江省农业科学院博士后工作站;哈尔滨市科技局项目(2014RFQYJ125);黑龙江省农业科学院创新工程项目(2014QN006);黑龙江省农业科学院博士人员科研启动金项目(201507 16);国家水稻产业技术体系项目(CARS 01 43); 北方寒地粳稻资源研究与新品种选育项目(2014BAD01B03 02)。
摘    要:利用Affymetrix水稻表达谱芯片(GeneChip Rice Genome Array)研究抗旱杂草稻HEB07-2与巴西陆稻(IAPAR9)在PEG模拟干旱胁迫下根系基因表达变化。结果表明,杂草稻HEB07-2转录组对干旱信号的响应程度与方向均与巴西陆稻存在很大差异,HEB07-2以正向调控为主,而巴西陆稻以负调控为主。干旱胁迫下杂草稻HEB07-2与巴西陆稻分别有6878个和2923个基因表达,其中HEB07-2受干旱胁迫诱导上调的基因有4693个,下调的基因有2185个;而巴西陆稻则分别有983个和1940个。在差异基因表达的倍数上也是HEB07-2高于巴西陆稻。进一步的GO分析表明,在干旱胁迫下,HEB07-2和IAPAR9根系基因响应途径的差异表现为HEB07-2在钾离子转运(GO:0006813)、次生物质代谢(GO:0019748)、细胞生长(GO:0016049)、葡萄糖代谢(GO:0006006)、跨膜离子转运器活性(GO:0015075)、亚铁血红素结合体(GO:0020037)、氧化还原酶活性(GO:0016491)等方面基因显著上调,这与生理数据和表型数据一致。

关 键 词:杂草稻    根系    表达谱芯片    耐旱  
收稿时间:2015-12-09

Global Genome Expression Analysis of Root Genes under Drought Stress in Weedy Rice and Up land Rice
DING Guo hua,#,SUN Jian,#,YANG Guang,ZHANG Feng ming,BAI Liang ming,SUN Shi chen,JIANG Shu kun,WANG Tong tong,ZHENG Hong liang,XIA Tian shu,SHEN Xi hong,MA Dian rong,CHEN.Global Genome Expression Analysis of Root Genes under Drought Stress in Weedy Rice and Up land Rice[J].Chinese Journal of Rice Science,2016,30(5):458-468.
Authors:DING Guo hua  #  SUN Jian  #  YANG Guang  ZHANG Feng ming  BAI Liang ming  SUN Shi chen  JIANG Shu kun  WANG Tong tong  ZHENG Hong liang  XIA Tian shu  SHEN Xi hong  MA Dian rong  CHEN
Institution:1.Postdoctoral Scientific Research Station of HAAS/Cultivation and Farming Research Institute of HASS/ Northern Japonica Rice Molecular Breeding Joint Research Center, Harbin  150086, China;;2.Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China; ;3.Institute of Economic Crop of Liaoning, Liaoyang 111000, China;;4.China National Rice Research Institute,Hangzhou 310006,China
Abstract:
Keywords:weedy rice  root  gene expression profiling  drought resistance
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