| 青稞叶绿体基因RNA编辑位点的预测、鉴定与比较分析 |
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| 引用本文： | 昌 西,裴 悦,胡 凡,任苗苗,王 彤,聂小军.青稞叶绿体基因RNA编辑位点的预测、鉴定与比较分析[J].麦类作物学报,2019(11):1316-1325. |
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| 作者姓名： | 昌 西 裴 悦 胡 凡 任苗苗 王 彤 聂小军 |
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| 作者单位： | (1.西藏农牧学院植物科学与技术学院，西藏林芝 860000； 2.西北农林科技大学农学院，陕西杨凌 712100) |
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| 基金项目： | 西部提升计划“作物学学科建设项目”（XBTSZWXK-2015）；中央财政支持地方高校“作物学学科建设项目”（ZYCZZWXK-2016) |
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| 摘 要： | 为了阐明青稞叶绿体基因组RNA编辑位点的组成与特性,首先利用生物信息工具对青稞叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测,结果发现了35个分布于15个基因的编辑位点,所有编辑均为C到U的转换,其中基因ndhB包含的编辑位点数量最多,达9个,这与其他麦类作物相似;进一步利用RT-PCR结合克隆测序,对预测的35个位点进行了实验验证,发现18个编辑位点被证实发生了C到U的编辑;对编辑前后编码蛋白质的结构进行了比较分析,发现RNA编辑引起了编码蛋白的结构变化,暗示RNA编辑可以造成编码蛋白功能的改变。最后,将青稞叶绿体基因RNA编辑位点与栽培大麦、野生大麦的叶绿体RNA编辑位点进行了比较,发现青稞与栽培大麦的RNA编辑组成完全一样,而野生大麦缺失了 ndhA-563位点,初步印证了大麦的起源进化关系。
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| 关 键 词： | 青稞 叶绿体 RNA编辑 RT-PCR |
Prediction,Identification and Characterization of the Chloroplast RNA Editing Sites of Hulless Barley |
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| CHANG Xi,PEI Yue,HU Fan,REN Miaomiao,WNAG Tong,NIE Xiaojun.Prediction,Identification and Characterization of the Chloroplast RNA Editing Sites of Hulless Barley[J].Journal of Triticeae Crops,2019(11):1316-1325. |
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| Authors: | CHANG Xi PEI Yue HU Fan REN Miaomiao WNAG Tong NIE Xiaojun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hulless barley Chloroplast RNA Editing RT-PCR |
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