| 二穗短柄草BURP家族基因的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 蒋 明,叶子弘,李金枝,管 铭,林 乐.二穗短柄草BURP家族基因的鉴定与分析[J].麦类作物学报,2015,35(9):1208-1214. |
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| 作者姓名： | 蒋 明 叶子弘 李金枝 管 铭 林 乐 |
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| 作者单位： | （1.台州学院浙江省植物进化生态学与保护重点实验室, 浙江椒江 318000； 2.中国计量学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室, 浙江杭州 310018） |
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| 基金项目： | 浙江省本科院校中青年学科带头人学术攀登项目（pd2013420）；浙江省植物进化生态学与保护重点实验室植物进化生态学创新团队专项 |
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| 摘 要： | BURP是一类植物特有蛋白，在生长发育和逆境防御中起着重要作用。为给后续的基因克隆、表达和功能验证奠定基础，根据二穗短柄草的基因组和蛋白质序列，利用生物信息学手段对BURP基因家族成员进行鉴定、染色体定位、序列分析和系统发育研究。结果表明，二穗短柄草有12个BURP基因，位于1~4号染色体上，在5号染色体上未见分布；BURP基因的全长为621~3 350 bp，具0~3个内含子，编码区全长621~2 316 bp，编码206~771个氨基酸，推导蛋白的等电点为5.02~9.51；12个BURP基因编码的蛋白分为5组，分别定名为RD22、PG1β、BURP-V、BURP-VI和BURP-VII，没有USP和BNM2类型的BURP蛋白；此外，根据4个半胱氨酸-组氨酸重复所间隔的氨基酸数量，二穗短柄草的BURP蛋白结构域可用CH/R-X10-CH-X25-36-CH-X22-25-CH-X8-W/F表示。
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| 关 键 词： | 二穗短柄草 BURP 基因家族 鉴定 |
Identification and Analysis of BURP Family Genes in Brachypodium distachyon |
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| JIANG Ming,YE Zihong,LI Jinzhi,GUAN Ming,LIN Le.Identification and Analysis of BURP Family Genes in Brachypodium distachyon[J].Journal of Triticeae Crops,2015,35(9):1208-1214. |
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| Authors: | JIANG Ming YE Zihong LI Jinzhi GUAN Ming LIN Le |
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| Institution: | (1.Zhejiang Provincial Key Laboratory of Plant Evolutionary Ecology and Conservation, Taizhou University, Jiaojiang, Zhejiang 318000, China; 2.Zhejiang Provincial Key Laboratory of Biometrology, Inspection and Quarantine, China Jiliang University, Hangzhou, Zhejiang 310018, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brachypodium distachyon BURP Gene family Identification |
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