| 二穗短柄草叶绿体RNA编辑位点的预测及其鉴定 |
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| 引用本文： | 石文清,邓平川,李变丽,牛善策,聂小军,王 乐,Abdul·Wahid·Baloch,宋卫宁.二穗短柄草叶绿体RNA编辑位点的预测及其鉴定[J].麦类作物学报,2012,32(1):28-35. |
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| 作者姓名： | 石文清 邓平川 李变丽 牛善策 聂小军 王 乐 Abdul·Wahid·Baloch 宋卫宁 |
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| 作者单位： | 1. 西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100／西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100
2. 西北农林科技大学农学院,陕西杨凌,712100
3. 西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100／西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100／旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌712100／国家小麦改良中心杨凌分中心,陕西杨凌712100 |
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| 基金项目： | 教育部高等学校科技创新工程重大项目培育基金项目（707054）。 |
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| 摘 要： | RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。为进一步探讨单子叶植物RNA编辑功能及其发生机制,本研究通过生物信息学方法,对二穗短柄草叶绿体的81个蛋白编码基因的RNA编辑位点进行了预测和鉴定分析,结果发现78个基因存在编辑位点,共检测到176个编辑位点,都是C到U的转换。其中ndhB最多,为14个编辑位点。为验证预测结果,利用blast工具比对了NCBI的二穗短柄草EST数据库,最终确定存在于17个基因中的34个编辑位点是真实存在的,其中19个为沉默编辑,15个为有效编辑。与5个不同单子叶禾本科物种18个蛋白编码基因的RNA编辑位点的比较发现,在rpoB-206位点,只有二穗短柄草发生了编辑,且只有ndhD-295(293)为部分编辑位点。
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| 关 键 词： | 二穗短柄草 叶绿体 RNA编辑位点 预测鉴定 |
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