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蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析
引用本文:代梦媛,敖 涛,徐 伟,刘爱忠.蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析[J].中国油料作物学报,2014,36(2):181.
作者姓名:代梦媛  敖 涛  徐 伟  刘爱忠
作者单位:1.中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源开放实验室,云南 勐腊,666303;2. 中国科学院昆明植物研究所,云南 昆明,650201;3.中国科学院大学,北京,100049
基金项目:中国科学院重点方向性项目(KSCX2-EW-Z-15)
摘    要:为揭示DNA糖基化酶在调节蓖麻生长发育和影响基因印记过程中的分子机理,本研究基于蓖麻全基因组、利用生物信息学的方法结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析,鉴别蓖麻DNA糖基化酶氨基酸序列的结构特征、系统发生和表达形式。结果显示:三种(DME、ROS和DML)DNA糖基化酶氨基酸均为不稳定氨基酸,具有典型的与DNA结合和碱基切除修复有关的保守结构域;系统进化分析发现三种DNA糖基化酶在植物中同源性强,而且是独立演化的结果;在不同组织的表达上,蓖麻的DME和ROS基因具有相似的表达形式,即在根、茎和叶中不表达,在胚乳中表达最高,而DML在各个组织中都未检测到基因的表达。

关 键 词:蓖麻  DNA糖基化酶  脱甲基化  表观调控

Sequence and expression analysis of DNA glycosylase in castor bean (Ricinus communis L.)
DAI Meng-yuan,AO Tao,XU Wei,LIU Ai-zhong.Sequence and expression analysis of DNA glycosylase in castor bean (Ricinus communis L.)[J].Chinese Journal of Oil Crop Sciences,2014,36(2):181.
Authors:DAI Meng-yuan  AO Tao  XU Wei  LIU Ai-zhong
Abstract:
Keywords:Key words: Ricinus communis  DNA glycosylase  Demethylation  Epigenetic regulation
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