| 基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析 |
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| 引用本文： | 邱红梅,厉志,于妍,高淑芹,马晓萍,郑宇宏,孟凡凡,侯云龙,王跃强,王曙明.基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析[J].中国油料作物学报,2015,37(2):141-147. |
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| 作者姓名： | 邱红梅 厉志 于妍 高淑芹 马晓萍 郑宇宏 孟凡凡 侯云龙 王跃强 王曙明 |
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| 作者单位： | 1.东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室，黑龙江 哈尔滨，150030；2.吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心，吉林 长春，130033；3.长春科技学院，吉林 长春，130600 |
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| 基金项目： | 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室开放基金项目（SB12A02）；国家高技术研究发展计划“863计划”（2012AA101106）；国家自然科学基金（31401404）；吉林省自然科学基金项目（20140101142JC） |
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| 摘 要： | 提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一。本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL。通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列。利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因。其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白。13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息。大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息。
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| 关 键 词： | 大豆 含硫氨基酸 元分析 Meta-QTL 候选基因 |
Mining and analysis of genes related to sulfur-containing amino acids in soybean based on Meta-QTL |
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| QIU Hong-mei,LI Zhi,YU Yan,GAO Shu-qin,MA Xiao-ping,ZHENG Yu-hong,MENG Fan-fan,HOU Yun-long,WANG Yue-qiang,WANG Shu-ming.Mining and analysis of genes related to sulfur-containing amino acids in soybean based on Meta-QTL[J].Chinese Journal of Oil Crop Sciences,2015,37(2):141-147. |
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| Authors: | QIU Hong-mei LI Zhi YU Yan GAO Shu-qin MA Xiao-ping ZHENG Yu-hong MENG Fan-fan HOU Yun-long WANG Yue-qiang WANG Shu-ming |
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| Institution: | QIU Hong-mei;LI Zhi;YU Yan;GAO Shu-qin;MA Xiao-ping;ZHENG Yu-hong;MENG Fan-fan;HOU Yun-long;WANG Yue-qiang;WANG Shu-ming;Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education,Northeast Agricultural University;Soybean Research Institute,Jilin Academy of Agricultural Sciences /National Engineering Research Center for Soybean;Changchun University of Science and Technology; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Soybean Sulfur-containing amino acids Meta-analysis Meta-QTLs Candidate genes |
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