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橡胶树前纤维蛋白(profilin)基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:邓治,李德军.橡胶树前纤维蛋白(profilin)基因家族的鉴定及表达分析[J].热带作物学报,2021,42(9):2443-2450.
作者姓名:邓治  李德军
作者单位:中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101
基金项目:中国热带农业科学院基本科研业务费专项(1630022019018);国家重点研发计划项目(2018YFD1000502);海南省自然科学基金项目(718MS038)
摘    要:肌动蛋白细胞骨架可能在橡胶树乳管伤口堵塞过程中发挥重要作用。前纤维蛋白(profilin)是肌动蛋白动态平衡的重要调节子,但对橡胶树profilin基因家族系统研究的报道较少。通过分析橡胶树基因组和转录组数据,鉴定到6个橡胶树profilin基因,对其基本特性及蛋白保守基序、结构特征、进化关系和表达模式等进行分析。基因结构分析表明,橡胶树profilin基因都包含3个外显子2个内含子,编码的蛋白序列含有profilin蛋白特有的保守基序KYMVIQGE和VIRGKKG。进化分析显示,橡胶树profilin并未严格分为营养型和生殖型2种类型。profilin蛋白二级结构以无规则卷曲为主,三级结构均包含3个α螺旋和7个β折叠。表达分析结果显示,4个profilin基因在胶乳中高表达,橡胶树排胶和碘化钾处理调控这4个profilin基因表达,推测profilin基因参与橡胶树排胶过程。该研究结果为进一步阐明橡胶树profilin基因在乳管伤口堵塞和排胶中的作用奠定基础。

关 键 词:前纤维蛋白基因家族  橡胶树  排胶  表达分析  
收稿时间:2020-12-16

Identification and Expression Analysis of profilin Gene Family in Hevea brasiliensis
DENG Zhi,LI Dejun.Identification and Expression Analysis of profilin Gene Family in Hevea brasiliensis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2021,42(9):2443-2450.
Authors:DENG Zhi  LI Dejun
Institution:Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences / Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Rubber Tree, Ministry of Agriculture and Rural Affairs / State Key Laboratory Incubation Base for Cultivation and Physiology of Tropical Crops, Haikou, Hainan 571101, China
Abstract:
Keywords:Profilin gene family  Hevea brasiliensis  latex flow  expression analysis  
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