| 甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李旭娟,林秀琴,刘洪博,李纯佳,徐超华,刘新龙.甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析[J].热带作物学报,2015,36(11):1978-1985. |
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| 作者姓名： | 李旭娟 林秀琴 刘洪博 李纯佳 徐超华 刘新龙 |
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| 作者单位： | 云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（No. 31360359）；云南省中青年学术技术带头人后备人才（No. 2014HB038）；云南省攻关项目（No. 2012BB014）；经济作物种质资源发掘与创新利用（No. 2013BAD01B03-15）；云南省应用基础研究计划青年项目（No. 2015FD063）。 |
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| 摘 要： | 以负调控禾本科植物分蘖的关键基因TB1为研究对象，根据水稻、玉米、高粱TB1同源基因保守序列设计引物，使用RT-PCR方法和RACE技术从甘蔗茎尖处克隆到该基因的同源基因ScTB1。ScTB1 cDNA全长1 668 bp，包含274 bp的5′ UTR，1 149 bp的CDS和245 bp的3′ UTR。生物信息学分析表明该基因可编码382个氨基酸残基，编码产物含有保守的SP区、TCP区和R区，属于TCP家族转录因子。其分子量为40.7 ku，理论等电点为8.55，蛋白亚细胞定位预测其主要定位于细胞质。系统进化分析表明ScTB1属于CYC/TB1亚族蛋白，与高粱TB1和玉米TB1聚为一个亚类。根据序列的保守性和预测结果可推测ScTB1很可能也参与了甘蔗分蘖性状的调控。
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| 关 键 词： | 甘蔗 分蘖 TB1基因 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of the TB1 Gene in Sugarcane |
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| LI Xujuan,LIN Xiuqin,LIU Hongbo,LI Chunji,XU Chaohua and LIU Xinlong.Cloning and Bioinformatics Analysis of the TB1 Gene in Sugarcane[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2015,36(11):1978-1985. |
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| Authors: | LI Xujuan LIN Xiuqin LIU Hongbo LI Chunji XU Chaohua and LIU Xinlong |
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| Institution: | Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences;Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences;Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences;Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences;Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences;Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement/Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane Tillering TB1 gene Cloning Bioinformatics analysis |
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