| 甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 吕爱丽,李旭娟,刘洪博,吴才文,曾千春,刘新龙.甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息学分析[J].热带作物学报,2016(6):1133-1140. |
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| 作者姓名： | 吕爱丽 李旭娟 刘洪博 吴才文 曾千春 刘新龙 |
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| 作者单位： | 1. 云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明,650201;2. 云南省农业科学院甘蔗研究所 云南省甘蔗遗传改良重点实验室 云南开远651699 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31360359)，云南省中青年学术技术带头人后备人才(2014HB038)，云南省应用基础研究计划青年项目(2015FD063) |
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| 摘 要： | D14是一类能够有效抑制水稻分蘖的水解酯酶,可能是独脚金内酯信号传导途径中的重要组分。为研究该基因在甘蔗分蘖性状中的功能,利用RT-PCR和RACE技术从甘蔗主栽品种ROC22中克隆出D14同源基因的c DNA全长,命名为Sc HTD2,并对其进行生物信息学分析。结果表明:Sc HTD2基因的c DNA全长为1 302 bp(KP137674.1),具有927 bp的开放阅读框,编码308个氨基酸;蛋白质分析表明,Sc HTD2为不稳定的水溶性非分泌蛋白,主要作用于氨基酸的生物合成或者作为生长因子调控生物生长发育。亚细胞定位于叶绿体,存在14个磷酸化位点,不存在乙酰化位点和信号肽。二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,还有一些残基形成β-折叠和链延伸。保守结构域和三级结构预测均表明该蛋白包含一个α保守水解酶家族,属"D14-Like"或者"DAD2-Like"蛋白家族。推测Sc HTD2可能作为独脚金内酯调控甘蔗分蘖信号转导中一个具有催化特性的水解脂酶而起作用。进化树分析表明该蛋白与高粱、玉米等单子叶植物进化关系较近。
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| 关 键 词： | 甘蔗 独脚金内酯 ScHTD2 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Full-Length cDNA Sequence of ScHTD2 Gene from Sugarcane |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane Strigolactones ScHTD2 Cloning Bioinformatics analysis |
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