巴西橡胶树简单重复序列的鉴定及分离

本研究利用巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）这一重要产胶植物的基因组文库进行了简单重复序列（SSRs），也即微卫星序列的分离鉴定。对来自无性系GT1的小插入基因组文库进行SSRs（AC/TG及CT/GA基序）筛选鉴定共获得154个克隆。采用载体通用引物及重复序列进行PCR扩增发现，其中114个为阳性克隆。限制性酶切分析结果显示，这些阳性克隆中有6个为重复拷贝，故予以剔除。之后，对剩余108个克隆中的50个进行了序列分析。此外，试验中对来自优良无性系RRII105的大插入基因组文库也进行了筛选。所获24个阳性克隆的测序结果也证实了橡胶基因组中微卫星序列的存在。经过最终的序列分析，本研究共鉴定出67个具有不同特点的简单及复合型微卫星序列，其中59个来自GT1，其余8个来自RRII105。所检测到的重复基序包括二核苷酸（TG/AC，AG/TC，TA/AT），三核苷酸（AAG，AGG，ATT），四核苷酸（GAAA，AAGG，ATCC，TAAA，AAAT），以及一个五核苷酸（GAAAT）。与其它作物的报道结果类似，在橡胶基因组中也观察到大量的CT/GA重复。