| 芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 漆艳香,蒲金基,张欣,陆英,张贺,张辉强,谢艺贤.芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析[J].热带作物学报,2011,32(4):663-667. |
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| 作者姓名： | 漆艳香 蒲金基 张欣 陆英 张贺 张辉强 谢艺贤 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所, 海南儋州571737;农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室, 海南儋州571737;海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室, 海南儋州571737
2. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海南儋州,571737 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目(No.2009hzs1J006); 公益性行业(农业)科研专项(200903034)资助 |
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| 摘 要： | 根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4 kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR。生物信息学分析表明,XcmR基因完整ORF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR/AsaR氨基酸序列具有86%~99%相似性。系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构。
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| 关 键 词： | 芒果细菌性黑斑病菌 群体感应 XcmR 生物信息学 |
Cloning and Sequence Analysis of XcmRfrom Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae |
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| QI Yanxiang,PU Jinji,HANG Xin,LU Ying,ZHANG He,ZHANG Huiqiang and XIE Yixian.Cloning and Sequence Analysis of XcmRfrom Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2011,32(4):663-667. |
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| Authors: | QI Yanxiang PU Jinji HANG Xin LU Ying ZHANG He ZHANG Huiqiang and XIE Yixian |
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| Institution: | QI Yanxiang1,2,3,PU Jinji1,ZHANG Xin1,LU Ying1,3 ZHANG He1,ZHANG Huiqiang1,XIE Yixian1,3 1 Environment and Plant Protection Institute,CATAS,Danzhou,Hainnan 571737,China 2 Key Laboratory of Monitoring and Control of Tropical Agricultural and Forest Invasive Alien Pests,Ministry of Agriculture,China 3 Hainan Key Laboratory for Monitoring and Control of Tropical Agricultural Pests,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Xanthomonas campestris pv mangiferaeindicae Quorum sensing XcmR Sequence analysis |
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