| 香蕉枯萎病菌cyp1基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 杨腊英,黄小娟,谢玉萍,羊玉花,杨歆璇,方晓东,黄俊生.香蕉枯萎病菌cyp1基因的克隆与序列分析[J].热带作物学报,2010,31(2):248-252. |
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| 作者姓名： | 杨腊英 黄小娟 谢玉萍 羊玉花 杨歆璇 方晓东 黄俊生 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室,海南儋州,571737
2. 华大基因研究院,广东深圳,518000 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No. 2008HZS1J003).国家科技支撑计划项目，2009年度公益性行业(农业)科技专项经费项目 |
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| 摘 要： | 为了解亲环素基因(cyp1,其编码亲和蛋白)在尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间及与其他镰刀菌之间的差异,分析cyp1基因与两生理小种之间的寄主选择性差异的关系,通过比对现有镰刀菌属的亲环素基因序列,设计并合成引物,采用PCR和RT-PCR方法扩增了尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号2个生理小种的cyp1基因,并测序进行比较分析,同时对编码蛋白进行了氨基酸序列比对和功能分析。结果表明,2个生理小种cyp1基因全长均为1066bp,开放阅读框均为675bp,编码224个氨基酸,基因序列间差异性为0.8%,编码蛋白间仅存在1个氨基酸的差异;两生理小种的cyp1基因序列与镰刀菌属其他专化型或不同种间存在差异性,与不同属之间其他种间的差异最大达50%,比对蛋白序列发现仅存在0.85%的差异,这进一步证明亲和蛋白在真菌中较保守。从cyp1基因序列及其编码蛋白的氨基酸序列在两生理小种之间的差异性分析结果推测,2个生理小种寄主选择性差异与cyp1基因并无明显对应关系,这为进一步研究cyp1基因功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 尖孢镰刀菌古巴专化型 生理小种 亲和蛋白基因 寄主选择性 |
Cloning and Sequence Analysis of cyp1 Gene of Fusarium oxysporum f sp. cubense |
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| Yang Laying,Huang Xiaojuan,Xie Yuping,Yang Yuhu,Yang Xinxuan,Fang Xiaodong and Huang Junsheng.Cloning and Sequence Analysis of cyp1 Gene of Fusarium oxysporum f sp. cubense[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2010,31(2):248-252. |
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| Authors: | Yang Laying Huang Xiaojuan Xie Yuping Yang Yuhu Yang Xinxuan Fang Xiaodong and Huang Junsheng |
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| Institution: | Yang Laying1,Huang Xiaojuan1,Xie Yuping1,Yang Yuhua1,Yang Xinxuan1,Fang Xiaodong2,Huang Junsheng1 1 Hainan Province Key Laboratory for Monitoring , Control of Tropical Agricultural Pests/Environment , Plant Protection Institute,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Danzhou,Hainan 571737,2 Beijing Genomics Institute,Shenzhen,Guangdong 518000 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fusan:um oxysporum f sp cubense race Cyclophilin A gene (cyp1) host selective preference |
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