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芋花叶病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
引用本文:施世明,王国平,徐文兴,王利平,洪霓.芋花叶病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析[J].园艺学报,2012,39(3):509-515.
作者姓名:施世明  王国平  徐文兴  王利平  洪霓
作者单位:1. 华中农业大学植物科技学院,湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室,武汉430070
2. 华中农业大学植物科技学院,湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室,武汉430070/华中农业大学,农业微生物学国家重点实验室,武汉430070
基金项目:国家农业行业专项计划项目(nyhyzx200903017-08)
摘    要: 采用RT-PCR技术对采自中国湖北、浙江和山东的91份芋Colocasia esculenta(L.)Schott]样品的芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus,DsMV)进行了检测,检出率为26.4%。对其中14个DsMV分离物的317 bp扩增产物(为外壳蛋白基因的一部分)序列分析的结果显示,各分离物内的核苷酸变异相对较低,而分离物间存在较大的分子变异,相似性为68.3% ~ 97.8%。对来自湖北和浙江的2个DsMV分离物DsMV-SCS和DsMV-JH的外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)进行了测序,全长分别为951 bp和987 bp,二者cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为79.0%和82.3%,与已报道DsMV的cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为73.0% ~ 92.1%和74.8% ~ 98.2%,在构建的系统发育树上聚在两个不同的簇,各DsMV分离物的系统进化关系与其寄主和地理来源无显著相关性。

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The Detection of Dasheen mosaic virus by RT-PCR and Sequence Analysis of Its Coat Protein Gene
SHI Shi-ming,WANG Guo-ping,XU Wen-xing,WANG Li-ping,and HONG Ni.The Detection of Dasheen mosaic virus by RT-PCR and Sequence Analysis of Its Coat Protein Gene[J].Acta Horticulturae Sinica,2012,39(3):509-515.
Authors:SHI Shi-ming  WANG Guo-ping  XU Wen-xing  WANG Li-ping  and HONG Ni
Institution:1,2,* (1College of Plant Science and Technology,Key Lab of Crop Disease Monitoring and Safety Control in Hubei,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;2National Key Lab of Agromicrobiology,Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070,China)
Abstract:
Keywords:taro  Dasheen mosaic virus  RT-PCR  coat protein gene  sequence analysis
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